Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPZ2Q9P299 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPZ2Q9P299 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPZ2Q9P299 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPZ2Q9P299 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPZ2Q9P299 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPZ2Q9P299 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ2Q9P299 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms