Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBAP1Q9NZ09 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBAP1Q9NZ09 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP1Q9NZ09 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBAP1Q9NZ09 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP1Q9NZ09 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBAP1Q9NZ09 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBAP1Q9NZ09 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms