Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPTLC3Q9NUV7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPTLC3Q9NUV7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPTLC3Q9NUV7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPTLC3Q9NUV7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPTLC3Q9NUV7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPTLC3Q9NUV7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPTLC3Q9NUV7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPTLC3Q9NUV7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPTLC3Q9NUV7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPTLC3Q9NUV7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPTLC3Q9NUV7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPTLC3Q9NUV7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPTLC3Q9NUV7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPTLC3Q9NUV7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPTLC3Q9NUV7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPTLC3Q9NUV7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms