Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM7Q9BQ49 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM7Q9BQ49 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM7Q9BQ49 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM7Q9BQ49 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM7Q9BQ49 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM7Q9BQ49 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM7Q9BQ49 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM7Q9BQ49 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM7Q9BQ49 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM7Q9BQ49 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM7Q9BQ49 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM7Q9BQ49 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms