Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN5Q99471 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN5Q99471 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN5Q99471 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN5Q99471 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN5Q99471 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN5Q99471 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN5Q99471 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN5Q99471 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PFDN5Q99471 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PFDN5Q99471 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PFDN5Q99471 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PFDN5Q99471 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PFDN5Q99471 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PFDN5Q99471 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PFDN5Q99471 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PFDN5Q99471 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PFDN5Q99471 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PFDN5Q99471 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PFDN5Q99471 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PFDN5Q99471 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PFDN5Q99471 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms