Protein–RNA interactions for Protein: Q99208

YLL066C, Y' element ATP-dependent helicase YLL066C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL066CQ99208 HIP1YGR191W 1812 nt13.09□□□□□ -0.31
YLL066CQ99208 ATG15YCR068W 1563 nt13.07□□□□□ -0.32
YLL066CQ99208 RAD51YER095W 1203 nt13.05□□□□□ -0.32
YLL066CQ99208 UTH1YKR042W 1098 nt13.05□□□□□ -0.32
YLL066CQ99208 YMR226CYMR226C 804 nt13.05□□□□□ -0.32
YLL066CQ99208 YGR012WYGR012W 1182 nt13.03□□□□□ -0.32
YLL066CQ99208 SAM1YLR180W 1149 nt13.03□□□□□ -0.32
YLL066CQ99208 NRT1YOR071C 1797 nt13.02□□□□□ -0.33
YLL066CQ99208 CLB6YGR109C 1143 nt13.01□□□□□ -0.33
YLL066CQ99208 TIF6YPR016C 738 nt13.01□□□□□ -0.33
YLL066CQ99208 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.99□□□□□ -0.33
YLL066CQ99208 MSB4YOL112W 1479 nt12.96□□□□□ -0.33
YLL066CQ99208 YLR279WYLR279W 390 nt12.94□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 PLB1YMR008C 1995 nt12.94□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 TSC10YBR265W 963 nt12.94□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 ARP6YLR085C 1317 nt12.91□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 RAD23YEL037C 1197 nt12.91□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 YML089CYML089C 369 nt12.91□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 LSC2YGR244C 1284 nt12.9□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 ZTA1YBR046C 1005 nt12.9□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 GAP1YKR039W 1809 nt12.9□□□□□ -0.34
YLL066CQ99208 RTN2YDL204W 1182 nt12.89□□□□□ -0.35
YLL066CQ99208 MET28YIR017C 564 nt12.88□□□□□ -0.35
YLL066CQ99208 YKR005CYKR005C 1578 nt12.81□□□□□ -0.36
YLL066CQ99208 RIB3YDR487C 627 nt12.8□□□□□ -0.36
YLL066CQ99208 BOR1YNL275W 1731 nt12.79□□□□□ -0.36
YLL066CQ99208 YGR259CYGR259C 441 nt12.79□□□□□ -0.36
YLL066CQ99208 UTR1YJR049C 1593 nt12.78□□□□□ -0.36
YLL066CQ99208 AKR2YOR034C 2250 nt12.77□□□□□ -0.37
YLL066CQ99208 HSP60YLR259C 1719 nt12.76□□□□□ -0.37
YLL066CQ99208 DIF1YLR437C 402 nt12.76□□□□□ -0.37
YLL066CQ99208 YLR349WYLR349W 507 nt12.74□□□□□ -0.37
YLL066CQ99208 LOT5YKL183W 921 nt12.71□□□□□ -0.37
YLL066CQ99208 AAC1YMR056C 930 nt12.71□□□□□ -0.37
YLL066CQ99208 YNR029CYNR029C 1290 nt12.71□□□□□ -0.37
YLL066CQ99208 NVJ2YPR091C 2313 nt12.71□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 PRM5YIL117C 957 nt12.7□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 STE4YOR212W 1272 nt12.7□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 RPM1RPM1 483 nt12.69□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 YAR028WYAR028W 705 nt12.69□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 FIT3YOR383C 615 nt12.69□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.69□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 PRP4YPR178W 1398 nt12.67□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 MTG2YHR168W 1557 nt12.66□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 ADH1YOL086C 1047 nt12.66□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 ADH7YCR105W 1086 nt12.65□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 APT2YDR441C 546 nt12.65□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 YJL195CYJL195C 702 nt12.65□□□□□ -0.38
YLL066CQ99208 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.64□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.64□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.64□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.64□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.64□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 BMT6YLR063W 1098 nt12.63□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 GND1YHR183W 1470 nt12.62□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 UGA4YDL210W 1716 nt12.6□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 GPN2YOR262W 1044 nt12.6□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 DPS1YLL018C 1674 nt12.6□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 FUN14YAL008W 597 nt12.59□□□□□ -0.39
YLL066CQ99208 PAU15YIR041W 375 nt12.57□□□□□ -0.4
YLL066CQ99208 SMM1YNR015W 1155 nt12.57□□□□□ -0.4
YLL066CQ99208 ALP1YNL270C 1722 nt12.56□□□□□ -0.4
YLL066CQ99208 YPI1YFR003C 468 nt12.54□□□□□ -0.4
YLL066CQ99208 RIB2YOL066C 1776 nt12.54□□□□□ -0.4
YLL066CQ99208 SNF1YDR477W 1902 nt12.53□□□□□ -0.4
YLL066CQ99208 PRY1YJL079C 900 nt12.51□□□□□ -0.41
YLL066CQ99208 SED1YDR077W 1017 nt12.49□□□□□ -0.41
YLL066CQ99208 YJL055WYJL055W 738 nt12.49□□□□□ -0.41
YLL066CQ99208 YPL251WYPL251W 303 nt12.49□□□□□ -0.41
YLL066CQ99208 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.48□□□□□ -0.41
YLL066CQ99208 FCY21YER060W 1587 nt12.46□□□□□ -0.41
YLL066CQ99208 YBL086CYBL086C 1401 nt12.41□□□□□ -0.42
YLL066CQ99208 YEL008WYEL008W 381 nt12.41□□□□□ -0.42
YLL066CQ99208 LIP1YMR298W 453 nt12.41□□□□□ -0.42
YLL066CQ99208 SAM35YHR083W 990 nt12.4□□□□□ -0.42
YLL066CQ99208 IRC24YIR036C 792 nt12.39□□□□□ -0.43
YLL066CQ99208 MEP3YPR138C 1470 nt12.38□□□□□ -0.43
YLL066CQ99208 YMR103CYMR103C 363 nt12.37□□□□□ -0.43
YLL066CQ99208 CPD1YGR247W 720 nt12.36□□□□□ -0.43
YLL066CQ99208 VRG4YGL225W 1014 nt12.35□□□□□ -0.43
YLL066CQ99208 HIF1YLL022C 1158 nt12.33□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 HXT1YHR094C 1713 nt12.33□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 DBP1YPL119C 1854 nt12.32□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 TOA2YKL058W 369 nt12.3□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 BRR1YPR057W 1026 nt12.3□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.3□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 HXT12YIL170W 1374 nt12.3□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 BIO5YNR056C 1686 nt12.29□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 ALD4YOR374W 1560 nt12.29□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 GND2YGR256W 1479 nt12.27□□□□□ -0.44
YLL066CQ99208 CSM1YCR086W 573 nt12.26□□□□□ -0.45
YLL066CQ99208 ESS1YJR017C 513 nt12.24□□□□□ -0.45
YLL066CQ99208 SSN3YPL042C 1668 nt12.21□□□□□ -0.45
YLL066CQ99208 SAM3YPL274W 1764 nt12.2□□□□□ -0.46
YLL066CQ99208 LEU9YOR108W 1815 nt12.2□□□□□ -0.46
YLL066CQ99208 BNI5YNL166C 1347 nt12.2□□□□□ -0.46
YLL066CQ99208 YJL118WYJL118W 660 nt12.19□□□□□ -0.46
YLL066CQ99208 SHY1YGR112W 1170 nt12.18□□□□□ -0.46
YLL066CQ99208 UFO1YML088W 2007 nt12.17□□□□□ -0.46
YLL066CQ99208 PAU5YFL020C 369 nt12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms