Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RORBQ92753 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RORBQ92753 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RORBQ92753 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RORBQ92753 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RORBQ92753 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORBQ92753 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORBQ92753 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORBQ92753 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORBQ92753 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RORBQ92753 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORBQ92753 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RORBQ92753 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RORBQ92753 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORBQ92753 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORBQ92753 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORBQ92753 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORBQ92753 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RORBQ92753 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RORBQ92753 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RORBQ92753 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RORBQ92753 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RORBQ92753 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RORBQ92753 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RORBQ92753 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RORBQ92753 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RORBQ92753 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RORBQ92753 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RORBQ92753 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RORBQ92753 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RORBQ92753 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RORBQ92753 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORBQ92753 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORBQ92753 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORBQ92753 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORBQ92753 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORBQ92753 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RORBQ92753 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RORBQ92753 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RORBQ92753 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RORBQ92753 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RORBQ92753 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RORBQ92753 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RORBQ92753 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RORBQ92753 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RORBQ92753 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RORBQ92753 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RORBQ92753 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RORBQ92753 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RORBQ92753 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RORBQ92753 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RORBQ92753 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RORBQ92753 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RORBQ92753 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RORBQ92753 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RORBQ92753 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RORBQ92753 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RORBQ92753 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RORBQ92753 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RORBQ92753 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RORBQ92753 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RORBQ92753 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RORBQ92753 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RORBQ92753 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RORBQ92753 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RORBQ92753 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RORBQ92753 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RORBQ92753 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORBQ92753 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RORBQ92753 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RORBQ92753 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RORBQ92753 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RORBQ92753 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORBQ92753 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORBQ92753 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORBQ92753 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORBQ92753 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RORBQ92753 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RORBQ92753 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RORBQ92753 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RORBQ92753 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RORBQ92753 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RORBQ92753 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RORBQ92753 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RORBQ92753 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RORBQ92753 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RORBQ92753 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RORBQ92753 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RORBQ92753 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RORBQ92753 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RORBQ92753 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RORBQ92753 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RORBQ92753 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RORBQ92753 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RORBQ92753 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RORBQ92753 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RORBQ92753 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RORBQ92753 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RORBQ92753 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RORBQ92753 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms