Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBZ0

INO80E, INO80 complex subunit E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80EQ8NBZ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INO80EQ8NBZ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
INO80EQ8NBZ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
INO80EQ8NBZ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INO80EQ8NBZ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80EQ8NBZ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INO80EQ8NBZ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INO80EQ8NBZ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INO80EQ8NBZ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms