Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.627e-8■■■■■ 102.9
AGGF1Q8N302 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.627e-8■■■■■ 102.9
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AGGF1Q8N302 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 419.69■□□□□ 0.744e-11■■■■■ 102.5
AGGF1Q8N302 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 417.53■□□□□ 0.44e-11■■■■■ 102.5
AGGF1Q8N302 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.164e-11■■■■■ 102.5
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AGGF1Q8N302 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 102
AGGF1Q8N302 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.861e-7■■■■■ 101.4
AGGF1Q8N302 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 101.4
AGGF1Q8N302 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 517.42■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 101.4
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AGGF1Q8N302 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 101.3
AGGF1Q8N302 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 101.3
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AGGF1Q8N302 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 516.33■□□□□ 0.22e-50■■■■■ 99.7
AGGF1Q8N302 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 514□□□□□ -0.172e-50■■■■■ 99.7
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AGGF1Q8N302 CNNM4-204ENST00000496186 748 ntTSL 39.98□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 96.7
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AGGF1Q8N302 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.058e-9■■■■■ 96.1
AGGF1Q8N302 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.428e-9■■■■■ 96.1
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AGGF1Q8N302 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-8■■■■■ 95.4
AGGF1Q8N302 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.127e-8■■■■■ 95
AGGF1Q8N302 SHC2-206ENST00000590222 951 ntTSL 516.32■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 95
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AGGF1Q8N302 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 94.2
AGGF1Q8N302 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 94.2
AGGF1Q8N302 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 94.2
AGGF1Q8N302 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 94.2
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AGGF1Q8N302 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 93.9
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AGGF1Q8N302 CEP192-207ENST00000508539 451 ntTSL 56.88□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 93.9
AGGF1Q8N302 CEP192-215ENST00000589993 3284 ntTSL 56.73□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 93.9
AGGF1Q8N302 CEP192-209ENST00000511820 6455 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 93.9
AGGF1Q8N302 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 93.9
AGGF1Q8N302 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.651e-8■■■■■ 93.9
AGGF1Q8N302 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 93.9
AGGF1Q8N302 CPZ-209ENST00000515606 2464 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 93.9
AGGF1Q8N302 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 93.9
AGGF1Q8N302 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 93.9
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AGGF1Q8N302 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.288e-9■■■■■ 93.3
AGGF1Q8N302 SNX9-202ENST00000614703 542 ntTSL 48.68□□□□□ -1.028e-9■■■■■ 93.3
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AGGF1Q8N302 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 92.8
AGGF1Q8N302 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.762e-11■■■■■ 92.7
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AGGF1Q8N302 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 92.1
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AGGF1Q8N302 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 92.1
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AGGF1Q8N302 NAPA-204ENST00000593905 548 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 91.7
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AGGF1Q8N302 C3-204ENST00000594936 625 ntTSL 216.21■□□□□ 0.193e-35■■■■■ 90.4
AGGF1Q8N302 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 90.4
AGGF1Q8N302 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.165e-10■■■■■ 90.1
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AGGF1Q8N302 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 89.8
AGGF1Q8N302 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 89.7
AGGF1Q8N302 LRRC27-209ENST00000475747 2660 ntTSL 217.14■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 89.7
AGGF1Q8N302 LRRC27-202ENST00000368612 1765 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 89.7
AGGF1Q8N302 LRRC27-206ENST00000462656 2302 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 89.7
AGGF1Q8N302 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 89.7
AGGF1Q8N302 LRRC27-208ENST00000472556 646 ntTSL 1 (best)8.71□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 89.7
AGGF1Q8N302 ADGRD1-203ENST00000376682 4135 ntTSL 212.43□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 88.7
AGGF1Q8N302 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 88.7
AGGF1Q8N302 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 88.7
AGGF1Q8N302 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 88.2
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AGGF1Q8N302 BX890604.1-203ENST00000483854 711 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 88.2
AGGF1Q8N302 GPT2-204ENST00000562801 2092 ntTSL 215.69■□□□□ 0.16e-17■■■■■ 87.9
AGGF1Q8N302 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 87.8
AGGF1Q8N302 GALNT2-202ENST00000485438 4030 ntTSL 511.92□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 87.8
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AGGF1Q8N302 MGRN1-214ENST00000591673 568 ntTSL 411.41□□□□□ -0.589e-9■■■■■ 86.9
AGGF1Q8N302 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.88□□□□□ -0.194e-13■■■■■ 86.4
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