Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWW0

LCN15, Lipocalin-15, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN15Q6UWW0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN15Q6UWW0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN15Q6UWW0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN15Q6UWW0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN15Q6UWW0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCN15Q6UWW0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN15Q6UWW0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN15Q6UWW0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN15Q6UWW0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN15Q6UWW0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN15Q6UWW0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN15Q6UWW0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN15Q6UWW0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms