Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C6orf89Q6UWU4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C6orf89Q6UWU4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C6orf89Q6UWU4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C6orf89Q6UWU4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C6orf89Q6UWU4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf89Q6UWU4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C6orf89Q6UWU4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms