Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRAIDQ6UW56 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRAIDQ6UW56 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRAIDQ6UW56 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRAIDQ6UW56 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRAIDQ6UW56 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms