Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO38Q6PIJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FBXO38Q6PIJ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXO38Q6PIJ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXO38Q6PIJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FBXO38Q6PIJ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FBXO38Q6PIJ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FBXO38Q6PIJ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO38Q6PIJ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO38Q6PIJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO38Q6PIJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO38Q6PIJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO38Q6PIJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO38Q6PIJ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO38Q6PIJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FBXO38Q6PIJ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO38Q6PIJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO38Q6PIJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO38Q6PIJ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO38Q6PIJ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO38Q6PIJ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO38Q6PIJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXO38Q6PIJ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO38Q6PIJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO38Q6PIJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXO38Q6PIJ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO38Q6PIJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO38Q6PIJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO38Q6PIJ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO38Q6PIJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO38Q6PIJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO38Q6PIJ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms