Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGB2Q6NT52 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGB2Q6NT52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGB2Q6NT52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGB2Q6NT52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGB2Q6NT52 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CGB2Q6NT52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGB2Q6NT52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CGB2Q6NT52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGB2Q6NT52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms