Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6LQ2NKX8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6LQ2NKX8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6LQ2NKX8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6LQ2NKX8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ERCC6LQ2NKX8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6LQ2NKX8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC6LQ2NKX8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6LQ2NKX8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6LQ2NKX8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6LQ2NKX8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms