Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.194e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 57.09□□□□□ -1.274e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.384e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 46.08□□□□□ -1.444e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 ASXL1-205ENST00000497249 296 ntTSL 53.77□□□□□ -1.814e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 PIGZ-201ENST00000238138 868 ntTSL 228.99■■■□□ 2.235e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.895e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.475e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.693e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 FOXJ3-207ENST00000445886 1326 ntTSL 1 (best)27.09■■□□□ 1.933e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.953e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.823e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.053e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.123e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 27.44□□□□□ -1.223e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.223e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 36.82□□□□□ -1.323e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.533e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.33e-6■■■□□ 19
SAFBQ15424 FUBP3-202ENST00000465949 676 ntTSL 55.39□□□□□ -1.553e-6■■■□□ 19
SAFBQ15424 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.686e-6■■■□□ 18.9
SAFBQ15424 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.616e-6■■■□□ 18.9
SAFBQ15424 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.757e-6■■■□□ 18.7
SAFBQ15424 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-6■■■□□ 18.7
SAFBQ15424 HIBCH-212ENST00000489147 3383 ntTSL 28.18□□□□□ -1.17e-6■■■□□ 18.7
SAFBQ15424 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.197e-6■■■□□ 18.7
SAFBQ15424 HIBCH-209ENST00000416732 502 ntTSL 25.23□□□□□ -1.577e-6■■■□□ 18.7
SAFBQ15424 HIBCH-205ENST00000409820 511 ntTSL 34.26□□□□□ -1.737e-6■■■□□ 18.7
SAFBQ15424 HIBCH-211ENST00000486981 581 ntTSL 43.91□□□□□ -1.787e-6■■■□□ 18.7
SAFBQ15424 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.255e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.725e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.375e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.095e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.195e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 AC024581.1-201ENST00000514791 566 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.365e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.015e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.085e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 KNL1-213ENST00000614337 3211 ntTSL 1 (best)7.5□□□□□ -1.215e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 AC106798.1-201ENST00000510621 585 ntTSL 45.4□□□□□ -1.545e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.51□□□□□ -2.015e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)29.34■■■□□ 2.292e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 221.23■□□□□ 0.992e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 18.6
SAFBQ15424 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.945e-6■■■□□ 18.5
SAFBQ15424 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.955e-6■■■□□ 18.5
SAFBQ15424 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.085e-6■■■□□ 18.5
SAFBQ15424 STK4-203ENST00000474717 722 ntTSL 37.37□□□□□ -1.235e-6■■■□□ 18.5
SAFBQ15424 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.473e-6■■■□□ 18.4
SAFBQ15424 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.728e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 MARCH6-211ENST00000512449 832 ntTSL 518.06■□□□□ 0.488e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 MARCH6-208ENST00000510792 1963 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.468e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.618e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 MARCH6-205ENST00000505253 676 ntTSL 311.04□□□□□ -0.648e-6■■■□□ 18.2
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SAFBQ15424 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 29.43□□□□□ -0.98e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.928e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.118e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 MIR548XHG-202ENST00000414582 615 ntTSL 37.47□□□□□ -1.218e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ISPD-AS1-201ENST00000436328 430 ntTSL 35.13□□□□□ -1.598e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.668e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.768e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.717e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.567e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 518.31■□□□□ 0.527e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.57e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 216.23■□□□□ 0.197e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.097e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.027e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.027e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 AL109613.1-203ENST00000417401 504 ntTSL 314.42□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 SCN9A-204ENST00000452182 1618 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.297e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 SCN9A-205ENST00000454569 1585 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.47e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 AL109613.1-205ENST00000446684 714 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 AL109613.1-204ENST00000412628 172 ntTSL 35.25□□□□□ -1.572e-6■■■□□ 18.2
SAFBQ15424 GALNT2-203ENST00000488903 593 ntTSL 228.93■■■□□ 2.228e-6■■■□□ 18.1
SAFBQ15424 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.38e-6■■■□□ 18.1
SAFBQ15424 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.168e-6■■■□□ 18.1
SAFBQ15424 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.018e-6■■■□□ 18.1
SAFBQ15424 GALNT2-205ENST00000494106 692 ntTSL 515.37■□□□□ 0.058e-6■■■□□ 18.1
SAFBQ15424 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.048e-6■■■□□ 18.1
SAFBQ15424 OPN3-204ENST00000469376 1961 ntTSL 1 (best)29.76■■■□□ 2.353e-6■■■□□ 17.9
SAFBQ15424 OPN3-205ENST00000478849 880 ntTSL 326.7■■□□□ 1.863e-6■■■□□ 17.9
SAFBQ15424 OPN3-206ENST00000490673 1816 ntTSL 1 (best)26.22■■□□□ 1.793e-6■■■□□ 17.9
SAFBQ15424 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.493e-6■■■□□ 17.9
SAFBQ15424 CHML-201ENST00000366553 7594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 17.9
SAFBQ15424 OPN3-203ENST00000463155 806 ntTSL 38□□□□□ -1.133e-6■■■□□ 17.9
SAFBQ15424 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-6■■■□□ 17.8
SAFBQ15424 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 17.8
SAFBQ15424 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 313.01□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 17.8
SAFBQ15424 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 17.8
SAFBQ15424 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 17.8
SAFBQ15424 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 27.84□□□□□ -1.152e-6■■■□□ 17.8
SAFBQ15424 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 35.89□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 17.8
SAFBQ15424 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.048e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.928e-6■■■□□ 17.7
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