RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436328.1

ISPD-AS1-201, ISPD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene ISPD-AS1, Length 430 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPD-AS1-201ENST00000436328 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.08■■■□□ 2.25
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ISPD-AS1-201ENST00000436328 FOXD1Q16676 465 aa23.9■■□□□ 1.42
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.42■■□□□ 1.34
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.67■■□□□ 1.22
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ADRA2BP18089 450 aa22.62■■□□□ 1.21
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ISPD-AS1-201ENST00000436328 MSH5O43196 834 aa22.19■■□□□ 1.14
ISPD-AS1-201ENST00000436328 POTEDQ86YR6 584 aa20.96■□□□□ 0.95
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
ISPD-AS1-201ENST00000436328 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.58■□□□□ 0.89
ISPD-AS1-201ENST00000436328 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.44■□□□□ 0.86
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.11■□□□□ 0.81
ISPD-AS1-201ENST00000436328 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
ISPD-AS1-201ENST00000436328 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
ISPD-AS1-201ENST00000436328 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ISPD-AS1-201ENST00000436328 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
ISPD-AS1-201ENST00000436328 KCNA4P22459 653 aa19.62■□□□□ 0.73
ISPD-AS1-201ENST00000436328 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.54■□□□□ 0.72
ISPD-AS1-201ENST00000436328 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.17■□□□□ 0.66
ISPD-AS1-201ENST00000436328 RNF39Q9H2S5 420 aa18.99■□□□□ 0.63
ISPD-AS1-201ENST00000436328 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.62
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
ISPD-AS1-201ENST00000436328 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SLC4A2P04920 1241 aa18.65■□□□□ 0.58
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
ISPD-AS1-201ENST00000436328 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
ISPD-AS1-201ENST00000436328 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ISPD-AS1-201ENST00000436328 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
ISPD-AS1-201ENST00000436328 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.17■□□□□ 0.5
ISPD-AS1-201ENST00000436328 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CAPN15O75808 1086 aa18.1■□□□□ 0.49
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ISPD-AS1-201ENST00000436328 APLP2Q06481 763 aa18.08■□□□□ 0.48
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ZBTB22O15209 634 aa18.05■□□□□ 0.48
ISPD-AS1-201ENST00000436328 DSG3P32926 999 aa17.92■□□□□ 0.46
ISPD-AS1-201ENST00000436328 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ABCB7O75027 752 aa17.71■□□□□ 0.43
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.6■□□□□ 0.41
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.6■□□□□ 0.41
ISPD-AS1-201ENST00000436328 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.56■□□□□ 0.4
ISPD-AS1-201ENST00000436328 POLA2Q14181 598 aa17.55■□□□□ 0.4
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
ISPD-AS1-201ENST00000436328 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
ISPD-AS1-201ENST00000436328 FBLN2P98095 1184 aa16.97■□□□□ 0.31
ISPD-AS1-201ENST00000436328 OSCARQ8IYS5 282 aa16.94■□□□□ 0.3
ISPD-AS1-201ENST00000436328 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
ISPD-AS1-201ENST00000436328 AKT1S1Q96B36 256 aa16.79■□□□□ 0.28
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.73■□□□□ 0.27
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SPDYE6P0CI01 402 aa16.73■□□□□ 0.27
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.73■□□□□ 0.27
ISPD-AS1-201ENST00000436328 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.55■□□□□ 0.24
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.54■□□□□ 0.24
ISPD-AS1-201ENST00000436328 POTEHQ6S545 545 aa16.5■□□□□ 0.23
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PITPNM1O00562 1244 aa16.43■□□□□ 0.22
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.31■□□□□ 0.2
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.26■□□□□ 0.19
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.24■□□□□ 0.19
ISPD-AS1-201ENST00000436328 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PRR29P0C7W0 189 aa16.07■□□□□ 0.16
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PROM2Q8N271 834 aa16.01■□□□□ 0.15
ISPD-AS1-201ENST00000436328 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.01■□□□□ 0.15
ISPD-AS1-201ENST00000436328 FKBP8Q14318 412 aa15.91■□□□□ 0.14
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CHADLQ6NUI6 762 aa15.91■□□□□ 0.14
ISPD-AS1-201ENST00000436328 HAX1O00165 279 aa15.82■□□□□ 0.12
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CREBZFQ9NS37 354 aa15.78■□□□□ 0.12
ISPD-AS1-201ENST00000436328 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
ISPD-AS1-201ENST00000436328 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.69■□□□□ 0.1
ISPD-AS1-201ENST00000436328 EVX2Q03828 476 aa15.68■□□□□ 0.1
ISPD-AS1-201ENST00000436328 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
ISPD-AS1-201ENST00000436328 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
ISPD-AS1-201ENST00000436328 MIER1Q8N108 512 aa15.52■□□□□ 0.08
ISPD-AS1-201ENST00000436328 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
ISPD-AS1-201ENST00000436328 FBXO3Q9UK99 471 aa15.48■□□□□ 0.07
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PLEKHG5O94827 1062 aa15.45■□□□□ 0.06
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.44■□□□□ 0.06
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.37■□□□□ 0.05
ISPD-AS1-201ENST00000436328 GABBR2O75899 941 aa15.35■□□□□ 0.05
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
ISPD-AS1-201ENST00000436328 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
ISPD-AS1-201ENST00000436328 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CLCN6P51797 869 aa15.27■□□□□ 0.04
ISPD-AS1-201ENST00000436328 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ISPD-AS1-201ENST00000436328 RASEFQ8IZ41 740 aa15.2■□□□□ 0.02
ISPD-AS1-201ENST00000436328 PHF12Q96QT6 1004 aa15.19■□□□□ 0.02
ISPD-AS1-201ENST00000436328 NUBP1P53384 320 aa15.18■□□□□ 0.02
ISPD-AS1-201ENST00000436328 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.5 ms