Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD3Q15059 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD3Q15059 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRD3Q15059 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRD3Q15059 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRD3Q15059 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRD3Q15059 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRD3Q15059 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD3Q15059 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
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