Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOFQ13790 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOFQ13790 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOFQ13790 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOFQ13790 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOFQ13790 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOFQ13790 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOFQ13790 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOFQ13790 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOFQ13790 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOFQ13790 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOFQ13790 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOFQ13790 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOFQ13790 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOFQ13790 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOFQ13790 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOFQ13790 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOFQ13790 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOFQ13790 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOFQ13790 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOFQ13790 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOFQ13790 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOFQ13790 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOFQ13790 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOFQ13790 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOFQ13790 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOFQ13790 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOFQ13790 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOFQ13790 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOFQ13790 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOFQ13790 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOFQ13790 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOFQ13790 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOFQ13790 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOFQ13790 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOFQ13790 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOFQ13790 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOFQ13790 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOFQ13790 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOFQ13790 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOFQ13790 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOFQ13790 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOFQ13790 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOFQ13790 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOFQ13790 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOFQ13790 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOFQ13790 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOFQ13790 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOFQ13790 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOFQ13790 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOFQ13790 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOFQ13790 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOFQ13790 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOFQ13790 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOFQ13790 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOFQ13790 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOFQ13790 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOFQ13790 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOFQ13790 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOFQ13790 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOFQ13790 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOFQ13790 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOFQ13790 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOFQ13790 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOFQ13790 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOFQ13790 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOFQ13790 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOFQ13790 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOFQ13790 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOFQ13790 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOFQ13790 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOFQ13790 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOFQ13790 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOFQ13790 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOFQ13790 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOFQ13790 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOFQ13790 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOFQ13790 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOFQ13790 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOFQ13790 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOFQ13790 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOFQ13790 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOFQ13790 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOFQ13790 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOFQ13790 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOFQ13790 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APOFQ13790 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOFQ13790 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOFQ13790 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOFQ13790 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOFQ13790 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOFQ13790 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOFQ13790 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOFQ13790 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOFQ13790 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOFQ13790 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOFQ13790 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOFQ13790 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOFQ13790 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOFQ13790 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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