Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 TOM6YOR045W 186 nt11.01□□□□□ -0.65
TRM11Q12463 TSC10YBR265W 963 nt10.98□□□□□ -0.65
TRM11Q12463 CAB5YDR196C 726 nt10.97□□□□□ -0.65
TRM11Q12463 PEX2YJL210W 816 nt10.97□□□□□ -0.65
TRM11Q12463 FUR4YBR021W 1902 nt10.96□□□□□ -0.65
TRM11Q12463 YGR012WYGR012W 1182 nt10.96□□□□□ -0.65
TRM11Q12463 HIP1YGR191W 1812 nt10.95□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 RPM1RPM1 483 nt10.95□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 RIB3YDR487C 627 nt10.94□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 POM34YLR018C 900 nt10.94□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 STE4YOR212W 1272 nt10.94□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 ALG12YNR030W 1656 nt10.94□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 NRT1YOR071C 1797 nt10.93□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 YNR029CYNR029C 1290 nt10.93□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 YLR349WYLR349W 507 nt10.91□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 YML089CYML089C 369 nt10.91□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 DUS1YML080W 1272 nt10.9□□□□□ -0.66
TRM11Q12463 MCH5YOR306C 1566 nt10.9□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 FUN14YAL008W 597 nt10.88□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 PRO1YDR300C 1287 nt10.87□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 LSC2YGR244C 1284 nt10.87□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 AQY2YLL052C 450 nt10.87□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 MET28YIR017C 564 nt10.86□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 STR3YGL184C 1398 nt10.86□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 YLR279WYLR279W 390 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 YJL195CYJL195C 702 nt10.84□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 TIF6YPR016C 738 nt10.84□□□□□ -0.67
TRM11Q12463 ADH7YCR105W 1086 nt10.82□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 ATG15YCR068W 1563 nt10.82□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 PAU15YIR041W 375 nt10.8□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 PRP4YPR178W 1398 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 ADH1YOL086C 1047 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 MSB4YOL112W 1479 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM11Q12463 YCL074WYCL074W 927 nt10.76□□□□□ -0.69
TRM11Q12463 FIT3YOR383C 615 nt10.76□□□□□ -0.69
TRM11Q12463 DPS1YLL018C 1674 nt10.75□□□□□ -0.69
TRM11Q12463 YPI1YFR003C 468 nt10.73□□□□□ -0.69
TRM11Q12463 ARP6YLR085C 1317 nt10.71□□□□□ -0.69
TRM11Q12463 AAC1YMR056C 930 nt10.71□□□□□ -0.69
TRM11Q12463 GPN2YOR262W 1044 nt10.7□□□□□ -0.7
TRM11Q12463 GAP1YKR039W 1809 nt10.68□□□□□ -0.7
TRM11Q12463 YEL008WYEL008W 381 nt10.67□□□□□ -0.7
TRM11Q12463 LOT5YKL183W 921 nt10.67□□□□□ -0.7
TRM11Q12463 GND1YHR183W 1470 nt10.67□□□□□ -0.7
TRM11Q12463 YJL225CYJL225C 5277 nt10.66□□□□□ -0.7
TRM11Q12463 SNF1YDR477W 1902 nt10.66□□□□□ -0.7
TRM11Q12463 YKR005CYKR005C 1578 nt10.65□□□□□ -0.7
TRM11Q12463 BIO5YNR056C 1686 nt10.64□□□□□ -0.71
TRM11Q12463 NAR1YNL240C 1476 nt10.64□□□□□ -0.71
TRM11Q12463 CPD1YGR247W 720 nt10.64□□□□□ -0.71
TRM11Q12463 ESS1YJR017C 513 nt10.6□□□□□ -0.71
TRM11Q12463 RTN2YDL204W 1182 nt10.58□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 APT2YDR441C 546 nt10.58□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.58□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 BMT6YLR063W 1098 nt10.58□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 PLB1YMR008C 1995 nt10.57□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 ALP1YNL270C 1722 nt10.57□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 YAR028WYAR028W 705 nt10.56□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 ZTA1YBR046C 1005 nt10.56□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 PBP1YGR178C 2169 nt10.55□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 DIF1YLR437C 402 nt10.54□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 SMM1YNR015W 1155 nt10.54□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 YGR259CYGR259C 441 nt10.53□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 AKR2YOR034C 2250 nt10.53□□□□□ -0.72
TRM11Q12463 MTG2YHR168W 1557 nt10.52□□□□□ -0.73
TRM11Q12463 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.49□□□□□ -0.73
TRM11Q12463 RIB2YOL066C 1776 nt10.48□□□□□ -0.73
TRM11Q12463 FCY21YER060W 1587 nt10.48□□□□□ -0.73
TRM11Q12463 UTR1YJR049C 1593 nt10.45□□□□□ -0.74
TRM11Q12463 IRC24YIR036C 792 nt10.45□□□□□ -0.74
TRM11Q12463 CYT2YKL087C 675 nt10.44□□□□□ -0.74
TRM11Q12463 SEN2YLR105C 1134 nt10.43□□□□□ -0.74
TRM11Q12463 NAP1YKR048C 1254 nt10.41□□□□□ -0.74
TRM11Q12463 HXT12YIL170W 1374 nt10.39□□□□□ -0.75
TRM11Q12463 PRY1YJL079C 900 nt10.39□□□□□ -0.75
TRM11Q12463 PUP1YOR157C 786 nt10.38□□□□□ -0.75
TRM11Q12463 VRG4YGL225W 1014 nt10.37□□□□□ -0.75
TRM11Q12463 UGA4YDL210W 1716 nt10.35□□□□□ -0.75
TRM11Q12463 PGC1YPL206C 966 nt10.34□□□□□ -0.75
TRM11Q12463 SED1YDR077W 1017 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 PAU5YFL020C 369 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 ALD4YOR374W 1560 nt10.32□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 SAM35YHR083W 990 nt10.32□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 YBR232CYBR232C 360 nt10.31□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 YJL055WYJL055W 738 nt10.3□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 YAT1YAR035W 2064 nt10.28□□□□□ -0.76
TRM11Q12463 STP3YLR375W 1032 nt10.27□□□□□ -0.77
TRM11Q12463 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
TRM11Q12463 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
TRM11Q12463 CCT5YJR064W 1689 nt10.26□□□□□ -0.77
TRM11Q12463 PRM5YIL117C 957 nt10.26□□□□□ -0.77
TRM11Q12463 LIP1YMR298W 453 nt10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms