Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 YLR111WYLR111W 333 nt10.21□□□□□ -0.77
LPX1Q12405 YCL074WYCL074W 927 nt10.2□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 PEX2YJL210W 816 nt10.19□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 HIP1YGR191W 1812 nt10.19□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 UTH1YKR042W 1098 nt10.18□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 LSC2YGR244C 1284 nt10.17□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 SDH5YOL071W 489 nt10.17□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 PRO1YDR300C 1287 nt10.16□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 SAM1YLR180W 1149 nt10.16□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 YML089CYML089C 369 nt10.16□□□□□ -0.78
LPX1Q12405 RAD23YEL037C 1197 nt10.13□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 YJL225CYJL225C 5277 nt10.13□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 NRT1YOR071C 1797 nt10.12□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.1□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 TIF6YPR016C 738 nt10.1□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 TSC10YBR265W 963 nt10.1□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 ATG15YCR068W 1563 nt10.09□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 CAB5YDR196C 726 nt10.09□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 MET28YIR017C 564 nt10.09□□□□□ -0.79
LPX1Q12405 ARP6YLR085C 1317 nt10.08□□□□□ -0.8
LPX1Q12405 FUR4YBR021W 1902 nt10.08□□□□□ -0.8
LPX1Q12405 YGR012WYGR012W 1182 nt10.08□□□□□ -0.8
LPX1Q12405 RIB3YDR487C 627 nt10.03□□□□□ -0.8
LPX1Q12405 CSM2YIL132C 642 nt10.03□□□□□ -0.8
LPX1Q12405 YLR279WYLR279W 390 nt10.03□□□□□ -0.8
LPX1Q12405 GAP1YKR039W 1809 nt10.03□□□□□ -0.8
LPX1Q12405 BOR1YNL275W 1731 nt10.02□□□□□ -0.81
LPX1Q12405 RTN2YDL204W 1182 nt10□□□□□ -0.81
LPX1Q12405 PLB1YMR008C 1995 nt9.99□□□□□ -0.81
LPX1Q12405 FIT3YOR383C 615 nt9.98□□□□□ -0.81
LPX1Q12405 MSB4YOL112W 1479 nt9.97□□□□□ -0.81
LPX1Q12405 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.93□□□□□ -0.82
LPX1Q12405 RAD51YER095W 1203 nt9.92□□□□□ -0.82
LPX1Q12405 YKR005CYKR005C 1578 nt9.91□□□□□ -0.82
LPX1Q12405 YGR259CYGR259C 441 nt9.9□□□□□ -0.82
LPX1Q12405 DIF1YLR437C 402 nt9.9□□□□□ -0.82
LPX1Q12405 MCH5YOR306C 1566 nt9.89□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 UTR1YJR049C 1593 nt9.87□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 YAR028WYAR028W 705 nt9.86□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 FUN14YAL008W 597 nt9.85□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 ADH1YOL086C 1047 nt9.85□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 STE4YOR212W 1272 nt9.85□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 ALP1YNL270C 1722 nt9.85□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 YJL195CYJL195C 702 nt9.84□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 ZTA1YBR046C 1005 nt9.84□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 MTG2YHR168W 1557 nt9.84□□□□□ -0.83
LPX1Q12405 YLR349WYLR349W 507 nt9.83□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 GND1YHR183W 1470 nt9.83□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 HSP60YLR259C 1719 nt9.82□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 YPI1YFR003C 468 nt9.82□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 PRP4YPR178W 1398 nt9.82□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 LOT5YKL183W 921 nt9.81□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 YNR029CYNR029C 1290 nt9.81□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 AKR2YOR034C 2250 nt9.8□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.78□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.78□□□□□ -0.84
LPX1Q12405 AAC1YMR056C 930 nt9.76□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 DPS1YLL018C 1674 nt9.76□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 APT2YDR441C 546 nt9.75□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 PAU21YOR394W 495 nt9.75□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 PAU22YPL282C 495 nt9.75□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 SMM1YNR015W 1155 nt9.74□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 FCY21YER060W 1587 nt9.73□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 BMT6YLR063W 1098 nt9.73□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 ADH7YCR105W 1086 nt9.72□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 PRM5YIL117C 957 nt9.72□□□□□ -0.85
LPX1Q12405 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.7□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.7□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 SAM35YHR083W 990 nt9.7□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 PAU15YIR041W 375 nt9.7□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.7□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.7□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.7□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 YEL008WYEL008W 381 nt9.69□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 IRC24YIR036C 792 nt9.68□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 RPM1RPM1 483 nt9.68□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 SED1YDR077W 1017 nt9.67□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 ARO7YPR060C 771 nt9.67□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 GPN2YOR262W 1044 nt9.66□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.65□□□□□ -0.86
LPX1Q12405 UGA4YDL210W 1716 nt9.65□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 RIB2YOL066C 1776 nt9.64□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 PRY1YJL079C 900 nt9.63□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 LIP1YMR298W 453 nt9.63□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 CPD1YGR247W 720 nt9.61□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 HXT12YIL170W 1374 nt9.61□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 ALG12YNR030W 1656 nt9.61□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 DBP1YPL119C 1854 nt9.6□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 SNF1YDR477W 1902 nt9.6□□□□□ -0.87
LPX1Q12405 YPL251WYPL251W 303 nt9.58□□□□□ -0.88
LPX1Q12405 VRG4YGL225W 1014 nt9.57□□□□□ -0.88
LPX1Q12405 ALD4YOR374W 1560 nt9.56□□□□□ -0.88
LPX1Q12405 YBL086CYBL086C 1401 nt9.55□□□□□ -0.88
LPX1Q12405 HXT1YHR094C 1713 nt9.54□□□□□ -0.88
LPX1Q12405 LEU9YOR108W 1815 nt9.54□□□□□ -0.88
LPX1Q12405 YJL055WYJL055W 738 nt9.53□□□□□ -0.88
LPX1Q12405 ESS1YJR017C 513 nt9.53□□□□□ -0.88
LPX1Q12405 HIF1YLL022C 1158 nt9.52□□□□□ -0.89
LPX1Q12405 BRR1YPR057W 1026 nt9.52□□□□□ -0.89
LPX1Q12405 YMR103CYMR103C 363 nt9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.5 ms