Protein–RNA interactions for Protein: Q12079

YPR027C, Uncharacterized membrane protein YPR027C, yeastyeast

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR027CQ12079 RPS14BYJL191W 417 nt10.5□□□□□ -0.73
YPR027CQ12079 YML089CYML089C 369 nt10.49□□□□□ -0.73
YPR027CQ12079 HIP1YGR191W 1812 nt10.49□□□□□ -0.73
YPR027CQ12079 UTH1YKR042W 1098 nt10.47□□□□□ -0.73
YPR027CQ12079 ARP6YLR085C 1317 nt10.47□□□□□ -0.73
YPR027CQ12079 YMR226CYMR226C 804 nt10.46□□□□□ -0.73
YPR027CQ12079 ATG15YCR068W 1563 nt10.46□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 RTN2YDL204W 1182 nt10.45□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 SDH5YOL071W 489 nt10.43□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 YLR111WYLR111W 333 nt10.42□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 TIF6YPR016C 738 nt10.42□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 YKR005CYKR005C 1578 nt10.42□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 NRT1YOR071C 1797 nt10.42□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 PLB1YMR008C 1995 nt10.41□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 NVJ2YPR091C 2313 nt10.41□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 HSP60YLR259C 1719 nt10.41□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 GAP1YKR039W 1809 nt10.4□□□□□ -0.74
YPR027CQ12079 YGR259CYGR259C 441 nt10.39□□□□□ -0.75
YPR027CQ12079 MET28YIR017C 564 nt10.39□□□□□ -0.75
YPR027CQ12079 TSC10YBR265W 963 nt10.36□□□□□ -0.75
YPR027CQ12079 PRP4YPR178W 1398 nt10.36□□□□□ -0.75
YPR027CQ12079 RAD23YEL037C 1197 nt10.34□□□□□ -0.75
YPR027CQ12079 YGR012WYGR012W 1182 nt10.33□□□□□ -0.76
YPR027CQ12079 CAB5YDR196C 726 nt10.31□□□□□ -0.76
YPR027CQ12079 YLR279WYLR279W 390 nt10.3□□□□□ -0.76
YPR027CQ12079 DPS1YLL018C 1674 nt10.29□□□□□ -0.76
YPR027CQ12079 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.28□□□□□ -0.76
YPR027CQ12079 UTR1YJR049C 1593 nt10.27□□□□□ -0.76
YPR027CQ12079 BMT6YLR063W 1098 nt10.27□□□□□ -0.77
YPR027CQ12079 FIT3YOR383C 615 nt10.27□□□□□ -0.77
YPR027CQ12079 SAM1YLR180W 1149 nt10.26□□□□□ -0.77
YPR027CQ12079 BOR1YNL275W 1731 nt10.25□□□□□ -0.77
YPR027CQ12079 DIF1YLR437C 402 nt10.25□□□□□ -0.77
YPR027CQ12079 MSB4YOL112W 1479 nt10.24□□□□□ -0.77
YPR027CQ12079 RIB3YDR487C 627 nt10.24□□□□□ -0.77
YPR027CQ12079 YAR028WYAR028W 705 nt10.21□□□□□ -0.77
YPR027CQ12079 NME1NME1 340 nt10.2□□□□□ -0.78
YPR027CQ12079 ZTA1YBR046C 1005 nt10.18□□□□□ -0.78
YPR027CQ12079 MTG2YHR168W 1557 nt10.18□□□□□ -0.78
YPR027CQ12079 IRC24YIR036C 792 nt10.17□□□□□ -0.78
YPR027CQ12079 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.17□□□□□ -0.78
YPR027CQ12079 ALP1YNL270C 1722 nt10.16□□□□□ -0.78
YPR027CQ12079 PRM5YIL117C 957 nt10.16□□□□□ -0.78
YPR027CQ12079 AKR2YOR034C 2250 nt10.15□□□□□ -0.78
YPR027CQ12079 AAC1YMR056C 930 nt10.14□□□□□ -0.79
YPR027CQ12079 SNF1YDR477W 1902 nt10.13□□□□□ -0.79
YPR027CQ12079 SAM35YHR083W 990 nt10.12□□□□□ -0.79
YPR027CQ12079 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.11□□□□□ -0.79
YPR027CQ12079 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.11□□□□□ -0.79
YPR027CQ12079 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.07□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.07□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.07□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.07□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.07□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 GND1YHR183W 1470 nt10.06□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 LOT5YKL183W 921 nt10.06□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 RPM1RPM1 483 nt10.06□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 SED1YDR077W 1017 nt10.04□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 FRE6YLL051C 2139 nt10.03□□□□□ -0.8
YPR027CQ12079 ADH1YOL086C 1047 nt10.02□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 YPI1YFR003C 468 nt10.01□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 FCY21YER060W 1587 nt10.01□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 ALD4YOR374W 1560 nt10.01□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 LIP1YMR298W 453 nt10□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 SMM1YNR015W 1155 nt10□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 APT2YDR441C 546 nt9.99□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 DBP1YPL119C 1854 nt9.99□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 RAD51YER095W 1203 nt9.98□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 YJL195CYJL195C 702 nt9.98□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 HIF1YLL022C 1158 nt9.98□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 FUN14YAL008W 597 nt9.97□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 YNR029CYNR029C 1290 nt9.97□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 BIO5YNR056C 1686 nt9.96□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 UGA4YDL210W 1716 nt9.96□□□□□ -0.81
YPR027CQ12079 HXT1YHR094C 1713 nt9.96□□□□□ -0.82
YPR027CQ12079 STE4YOR212W 1272 nt9.95□□□□□ -0.82
YPR027CQ12079 YBL086CYBL086C 1401 nt9.94□□□□□ -0.82
YPR027CQ12079 YPL251WYPL251W 303 nt9.93□□□□□ -0.82
YPR027CQ12079 PRY1YJL079C 900 nt9.92□□□□□ -0.82
YPR027CQ12079 YLR349WYLR349W 507 nt9.92□□□□□ -0.82
YPR027CQ12079 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.9□□□□□ -0.82
YPR027CQ12079 LEU9YOR108W 1815 nt9.89□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 BRR1YPR057W 1026 nt9.89□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 ALG12YNR030W 1656 nt9.89□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 RIB2YOL066C 1776 nt9.88□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 MEP3YPR138C 1470 nt9.87□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 TOA2YKL058W 369 nt9.87□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 YMR103CYMR103C 363 nt9.87□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 HXT12YIL170W 1374 nt9.85□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 YEL008WYEL008W 381 nt9.84□□□□□ -0.83
YPR027CQ12079 VRG4YGL225W 1014 nt9.83□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 SHY1YGR112W 1170 nt9.83□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 ADH7YCR105W 1086 nt9.81□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 YJL055WYJL055W 738 nt9.81□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 GND2YGR256W 1479 nt9.8□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 CSM1YCR086W 573 nt9.79□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 PAU15YIR041W 375 nt9.79□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 GPN2YOR262W 1044 nt9.79□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 UFO1YML088W 2007 nt9.78□□□□□ -0.84
YPR027CQ12079 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms