Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 HIP1YGR191W 1812 nt11.23□□□□□ -0.61
DSE3Q08729 YML089CYML089C 369 nt11.23□□□□□ -0.61
DSE3Q08729 ATG15YCR068W 1563 nt11.22□□□□□ -0.61
DSE3Q08729 ARP6YLR085C 1317 nt11.21□□□□□ -0.61
DSE3Q08729 UTH1YKR042W 1098 nt11.21□□□□□ -0.61
DSE3Q08729 SDH5YOL071W 489 nt11.21□□□□□ -0.61
DSE3Q08729 YMR226CYMR226C 804 nt11.2□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 RTN2YDL204W 1182 nt11.19□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 TIF6YPR016C 738 nt11.18□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 YKR005CYKR005C 1578 nt11.18□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 NRT1YOR071C 1797 nt11.18□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 PLB1YMR008C 1995 nt11.17□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 YLR111WYLR111W 333 nt11.17□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 HSP60YLR259C 1719 nt11.17□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 GAP1YKR039W 1809 nt11.16□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 YGR259CYGR259C 441 nt11.16□□□□□ -0.62
DSE3Q08729 MET28YIR017C 564 nt11.13□□□□□ -0.63
DSE3Q08729 PRP4YPR178W 1398 nt11.13□□□□□ -0.63
DSE3Q08729 TSC10YBR265W 963 nt11.1□□□□□ -0.63
DSE3Q08729 YGR012WYGR012W 1182 nt11.08□□□□□ -0.64
DSE3Q08729 CAB5YDR196C 726 nt11.07□□□□□ -0.64
DSE3Q08729 RAD23YEL037C 1197 nt11.07□□□□□ -0.64
DSE3Q08729 DPS1YLL018C 1674 nt11.05□□□□□ -0.64
DSE3Q08729 YLR279WYLR279W 390 nt11.03□□□□□ -0.64
DSE3Q08729 UTR1YJR049C 1593 nt11.03□□□□□ -0.64
DSE3Q08729 BMT6YLR063W 1098 nt11.02□□□□□ -0.65
DSE3Q08729 BOR1YNL275W 1731 nt11.01□□□□□ -0.65
DSE3Q08729 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.01□□□□□ -0.65
DSE3Q08729 DIF1YLR437C 402 nt10.99□□□□□ -0.65
DSE3Q08729 FIT3YOR383C 615 nt10.99□□□□□ -0.65
DSE3Q08729 MSB4YOL112W 1479 nt10.99□□□□□ -0.65
DSE3Q08729 RIB3YDR487C 627 nt10.97□□□□□ -0.65
DSE3Q08729 SAM1YLR180W 1149 nt10.97□□□□□ -0.65
DSE3Q08729 YJL225CYJL225C 5277 nt10.93□□□□□ -0.66
DSE3Q08729 YAR028WYAR028W 705 nt10.93□□□□□ -0.66
DSE3Q08729 ZTA1YBR046C 1005 nt10.93□□□□□ -0.66
DSE3Q08729 PRM5YIL117C 957 nt10.92□□□□□ -0.66
DSE3Q08729 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.92□□□□□ -0.66
DSE3Q08729 IRC24YIR036C 792 nt10.91□□□□□ -0.66
DSE3Q08729 MTG2YHR168W 1557 nt10.9□□□□□ -0.66
DSE3Q08729 ALP1YNL270C 1722 nt10.89□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 AKR2YOR034C 2250 nt10.89□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 AAC1YMR056C 930 nt10.87□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 SNF1YDR477W 1902 nt10.87□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 SAM35YHR083W 990 nt10.84□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
DSE3Q08729 LOT5YKL183W 921 nt10.78□□□□□ -0.68
DSE3Q08729 GND1YHR183W 1470 nt10.78□□□□□ -0.68
DSE3Q08729 SED1YDR077W 1017 nt10.76□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 Q0182Q0182 405 nt10.76□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 ALD4YOR374W 1560 nt10.74□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 LIP1YMR298W 453 nt10.74□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 SMM1YNR015W 1155 nt10.74□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 ADH1YOL086C 1047 nt10.74□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 APT2YDR441C 546 nt10.73□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 YPI1YFR003C 468 nt10.72□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 HIF1YLL022C 1158 nt10.72□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 FCY21YER060W 1587 nt10.71□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 RAD51YER095W 1203 nt10.71□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 YJL195CYJL195C 702 nt10.71□□□□□ -0.69
DSE3Q08729 DBP1YPL119C 1854 nt10.7□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 UGA4YDL210W 1716 nt10.7□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 BIO5YNR056C 1686 nt10.7□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 YNR029CYNR029C 1290 nt10.69□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 HXT1YHR094C 1713 nt10.68□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 FUN14YAL008W 597 nt10.68□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 STE4YOR212W 1272 nt10.66□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 YPL251WYPL251W 303 nt10.66□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 YBL086CYBL086C 1401 nt10.66□□□□□ -0.7
DSE3Q08729 PRY1YJL079C 900 nt10.63□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 BRR1YPR057W 1026 nt10.63□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.62□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 ALG12YNR030W 1656 nt10.61□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 TOA2YKL058W 369 nt10.61□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 YLR349WYLR349W 507 nt10.61□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 YMR103CYMR103C 363 nt10.61□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 RIB2YOL066C 1776 nt10.61□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 MEP3YPR138C 1470 nt10.61□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 LEU9YOR108W 1815 nt10.6□□□□□ -0.71
DSE3Q08729 VRG4YGL225W 1014 nt10.56□□□□□ -0.72
DSE3Q08729 SHY1YGR112W 1170 nt10.55□□□□□ -0.72
DSE3Q08729 GND2YGR256W 1479 nt10.55□□□□□ -0.72
DSE3Q08729 YJL055WYJL055W 738 nt10.54□□□□□ -0.72
DSE3Q08729 GPN2YOR262W 1044 nt10.54□□□□□ -0.72
DSE3Q08729 HXT12YIL170W 1374 nt10.53□□□□□ -0.72
DSE3Q08729 YEL008WYEL008W 381 nt10.53□□□□□ -0.72
DSE3Q08729 ADH7YCR105W 1086 nt10.52□□□□□ -0.73
DSE3Q08729 UME6YDR207C 2511 nt10.51□□□□□ -0.73
DSE3Q08729 CSM1YCR086W 573 nt10.51□□□□□ -0.73
DSE3Q08729 PAU15YIR041W 375 nt10.51□□□□□ -0.73
DSE3Q08729 RPM1RPM1 483 nt10.51□□□□□ -0.73
DSE3Q08729 UFO1YML088W 2007 nt10.48□□□□□ -0.73
DSE3Q08729 SSN3YPL042C 1668 nt10.48□□□□□ -0.73
DSE3Q08729 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.48□□□□□ -0.73
DSE3Q08729 BNI5YNL166C 1347 nt10.45□□□□□ -0.74
DSE3Q08729 ZRT3YKL175W 1512 nt10.44□□□□□ -0.74
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