Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 MRPL8YJL063C 717 nt9.06□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 VPS75YNL246W 795 nt9.04□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 HOL1YNR055C 1761 nt9.04□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 HUA1YGR268C 597 nt9.03□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 ADO1YJR105W 1023 nt9.03□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 SHH4YLR164W 507 nt9.03□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 PEX25YPL112C 1185 nt9.03□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 ATG15YCR068W 1563 nt9.02□□□□□ -0.97
NEJ1Q06148 HXT1YHR094C 1713 nt9.02□□□□□ -0.97
NEJ1Q06148 DBP1YPL119C 1854 nt9□□□□□ -0.97
NEJ1Q06148 POM34YLR018C 900 nt9□□□□□ -0.97
NEJ1Q06148 ILV3YJR016C 1758 nt8.99□□□□□ -0.97
NEJ1Q06148 YML089CYML089C 369 nt8.99□□□□□ -0.97
NEJ1Q06148 DIF1YLR437C 402 nt8.98□□□□□ -0.97
NEJ1Q06148 YNL024CYNL024C 741 nt8.98□□□□□ -0.97
NEJ1Q06148 SHY1YGR112W 1170 nt8.95□□□□□ -0.98
NEJ1Q06148 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.93□□□□□ -0.98
NEJ1Q06148 PAU7YAR020C 168 nt8.92□□□□□ -0.98
NEJ1Q06148 YOR325WYOR325W 474 nt8.9□□□□□ -0.98
NEJ1Q06148 SSN3YPL042C 1668 nt8.89□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 YFL066CYFL066C 1179 nt8.88□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.88□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 MAE1YKL029C 2010 nt8.88□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 RET2YFR051C 1641 nt8.87□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 CWC15YDR163W 528 nt8.87□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 HIS2YFR025C 1008 nt8.87□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 LIP1YMR298W 453 nt8.87□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 PRE6YOL038W 765 nt8.87□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 TOM6YOR045W 186 nt8.87□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 OPI10YOL032W 741 nt8.86□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 YBL086CYBL086C 1401 nt8.86□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 SFA1YDL168W 1161 nt8.85□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 SED1YDR077W 1017 nt8.85□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 URA6YKL024C 615 nt8.85□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 COQ8YGL119W 1506 nt8.85□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 MRP20YDR405W 792 nt8.84□□□□□ -0.99
NEJ1Q06148 YAR028WYAR028W 705 nt8.83□□□□□ -1
NEJ1Q06148 YDR010CYDR010C 333 nt8.82□□□□□ -1
NEJ1Q06148 SHB17YKR043C 816 nt8.81□□□□□ -1
NEJ1Q06148 TIF6YPR016C 738 nt8.81□□□□□ -1
NEJ1Q06148 YMR209CYMR209C 1374 nt8.81□□□□□ -1
NEJ1Q06148 CCT2YIL142W 1584 nt8.81□□□□□ -1
NEJ1Q06148 GID7YCL039W 2238 nt8.8□□□□□ -1
NEJ1Q06148 SAM1YLR180W 1149 nt8.8□□□□□ -1
NEJ1Q06148 UGP1YKL035W 1500 nt8.8□□□□□ -1
NEJ1Q06148 ARO8YGL202W 1503 nt8.79□□□□□ -1
NEJ1Q06148 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.78□□□□□ -1
NEJ1Q06148 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.78□□□□□ -1
NEJ1Q06148 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.78□□□□□ -1
NEJ1Q06148 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.78□□□□□ -1
NEJ1Q06148 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.78□□□□□ -1
NEJ1Q06148 UFO1YML088W 2007 nt8.78□□□□□ -1
NEJ1Q06148 YFR018CYFR018C 1092 nt8.77□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 PEX2YJL210W 816 nt8.77□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 KES1YPL145C 1305 nt8.77□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 LEU9YOR108W 1815 nt8.75□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 PET8YNL003C 855 nt8.75□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 HIP1YGR191W 1812 nt8.75□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 ACO2YJL200C 2370 nt8.75□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 TOA2YKL058W 369 nt8.74□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 OYE3YPL171C 1203 nt8.74□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 BET2YPR176C 978 nt8.74□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 MET2YNL277W 1461 nt8.74□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 SGA1YIL099W 1650 nt8.74□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 MET28YIR017C 564 nt8.73□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 MTG2YHR168W 1557 nt8.73□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 BRR1YPR057W 1026 nt8.72□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 SFP1YLR403W 2052 nt8.71□□□□□ -1.01
NEJ1Q06148 PHO89YBR296C 1725 nt8.71□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 FRE6YLL051C 2139 nt8.71□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 NPP1YCR026C 2229 nt8.7□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 AKR2YOR034C 2250 nt8.69□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 LSB6YJL100W 1824 nt8.69□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 YPL251WYPL251W 303 nt8.69□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.68□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 GND2YGR256W 1479 nt8.67□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 ALP1YNL270C 1722 nt8.67□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 PSD1YNL169C 1503 nt8.66□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 UBA4YHR111W 1323 nt8.66□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 SPP2YOR148C 558 nt8.66□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 VPS62YGR141W 1404 nt8.65□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 MIR1YJR077C 936 nt8.65□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 CYT1YOR065W 930 nt8.65□□□□□ -1.02
NEJ1Q06148 NRT1YOR071C 1797 nt8.64□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 COQ2YNR041C 1119 nt8.64□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 FIT3YOR383C 615 nt8.64□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 ZTA1YBR046C 1005 nt8.64□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 FMS1YMR020W 1527 nt8.64□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 RSC8YFR037C 1674 nt8.63□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 QDR2YIL121W 1629 nt8.63□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 YDR094WYDR094W 336 nt8.63□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 SAM2YDR502C 1155 nt8.63□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 ACH1YBL015W 1581 nt8.63□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 YCR087WYCR087W 516 nt8.62□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 YDL086WYDL086W 822 nt8.62□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 UTH1YKR042W 1098 nt8.62□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 DMA2YNL116W 1569 nt8.61□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 ZAP1YJL056C 2643 nt8.61□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 MEP3YPR138C 1470 nt8.61□□□□□ -1.03
NEJ1Q06148 RRT5YFR032C 870 nt8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms