Protein–RNA interactions for Protein: Q04311

VMS1, Protein VMS1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VMS1Q04311 PAU7YAR020C 168 nt11.16□□□□□ -0.62
VMS1Q04311 UTR1YJR049C 1593 nt11.16□□□□□ -0.62
VMS1Q04311 GAP1YKR039W 1809 nt11.14□□□□□ -0.63
VMS1Q04311 UBA4YHR111W 1323 nt11.13□□□□□ -0.63
VMS1Q04311 HIF1YLL022C 1158 nt11.1□□□□□ -0.63
VMS1Q04311 THI74YDR438W 1113 nt11.09□□□□□ -0.63
VMS1Q04311 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.09□□□□□ -0.63
VMS1Q04311 TOM6YOR045W 186 nt11.06□□□□□ -0.64
VMS1Q04311 YAT1YAR035W 2064 nt11.05□□□□□ -0.64
VMS1Q04311 ALD4YOR374W 1560 nt11.04□□□□□ -0.64
VMS1Q04311 YML089CYML089C 369 nt11.04□□□□□ -0.64
VMS1Q04311 PHO89YBR296C 1725 nt11.04□□□□□ -0.64
VMS1Q04311 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.03□□□□□ -0.64
VMS1Q04311 ATG15YCR068W 1563 nt11.03□□□□□ -0.64
VMS1Q04311 DIF1YLR437C 402 nt11.02□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 COQ2YNR041C 1119 nt11.02□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 MSF1YPR047W 1410 nt11.01□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.01□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.01□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 TIF6YPR016C 738 nt11□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 HIP1YGR191W 1812 nt11□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 YSR3YKR053C 1215 nt10.98□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 NAT4YMR069W 858 nt10.97□□□□□ -0.65
VMS1Q04311 PEX2YJL210W 816 nt10.95□□□□□ -0.66
VMS1Q04311 DBP1YPL119C 1854 nt10.94□□□□□ -0.66
VMS1Q04311 XYL2YLR070C 1071 nt10.94□□□□□ -0.66
VMS1Q04311 YGL034CYGL034C 366 nt10.93□□□□□ -0.66
VMS1Q04311 HSL7YBR133C 2484 nt10.91□□□□□ -0.66
VMS1Q04311 YCR087WYCR087W 516 nt10.88□□□□□ -0.67
VMS1Q04311 SAM35YHR083W 990 nt10.87□□□□□ -0.67
VMS1Q04311 AIM45YPR004C 1035 nt10.87□□□□□ -0.67
VMS1Q04311 MRP20YDR405W 792 nt10.85□□□□□ -0.67
VMS1Q04311 RPC82YPR190C 1965 nt10.84□□□□□ -0.67
VMS1Q04311 MET28YIR017C 564 nt10.83□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 MTG2YHR168W 1557 nt10.82□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 RPS14BYJL191W 417 nt10.82□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 YAR028WYAR028W 705 nt10.82□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 ZRT3YKL175W 1512 nt10.81□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 RPL4BYDR012W 1089 nt10.81□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 RPL4AYBR031W 1089 nt10.81□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 NDI1YML120C 1542 nt10.79□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 NRT1YOR071C 1797 nt10.78□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 YBL086CYBL086C 1401 nt10.78□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 UTH1YKR042W 1098 nt10.78□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 HXT1YHR094C 1713 nt10.78□□□□□ -0.68
VMS1Q04311 ZTA1YBR046C 1005 nt10.77□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 SHY1YGR112W 1170 nt10.76□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 YJL067WYJL067W 351 nt10.76□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 CMP2YML057W 1815 nt10.75□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 SED1YDR077W 1017 nt10.72□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 CLB6YGR109C 1143 nt10.72□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 RBG1YAL036C 1110 nt10.72□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 SPT20YOL148C 1815 nt10.72□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 UFO1YML088W 2007 nt10.71□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 LIP1YMR298W 453 nt10.71□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 LEU9YOR108W 1815 nt10.71□□□□□ -0.69
VMS1Q04311 INA1YLR413W 2028 nt10.7□□□□□ -0.7
VMS1Q04311 FIT3YOR383C 615 nt10.7□□□□□ -0.7
VMS1Q04311 YPL251WYPL251W 303 nt10.69□□□□□ -0.7
VMS1Q04311 ALP1YNL270C 1722 nt10.69□□□□□ -0.7
VMS1Q04311 AKR2YOR034C 2250 nt10.67□□□□□ -0.7
VMS1Q04311 SBA1YKL117W 651 nt10.66□□□□□ -0.7
VMS1Q04311 YLR279WYLR279W 390 nt10.64□□□□□ -0.71
VMS1Q04311 URA6YKL024C 615 nt10.62□□□□□ -0.71
VMS1Q04311 BSP1YPR171W 1731 nt10.61□□□□□ -0.71
VMS1Q04311 BRR1YPR057W 1026 nt10.59□□□□□ -0.71
VMS1Q04311 TSC10YBR265W 963 nt10.59□□□□□ -0.71
VMS1Q04311 MSB4YOL112W 1479 nt10.59□□□□□ -0.71
VMS1Q04311 HEL2YDR266C 1920 nt10.58□□□□□ -0.72
VMS1Q04311 CAB5YDR196C 726 nt10.55□□□□□ -0.72
VMS1Q04311 UGA4YDL210W 1716 nt10.54□□□□□ -0.72
VMS1Q04311 YGR012WYGR012W 1182 nt10.54□□□□□ -0.72
VMS1Q04311 SAM1YLR180W 1149 nt10.54□□□□□ -0.72
VMS1Q04311 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.51□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 TOA2YKL058W 369 nt10.51□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 OYE3YPL171C 1203 nt10.51□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 HOL1YNR055C 1761 nt10.5□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 YMR103CYMR103C 363 nt10.5□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 YOR325WYOR325W 474 nt10.5□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 ILV3YJR016C 1758 nt10.49□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 GND2YGR256W 1479 nt10.49□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 FCY21YER060W 1587 nt10.49□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 ACH1YBL015W 1581 nt10.48□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 MEP3YPR138C 1470 nt10.47□□□□□ -0.73
VMS1Q04311 SSN3YPL042C 1668 nt10.46□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 FLR1YBR008C 1647 nt10.45□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 FMS1YMR020W 1527 nt10.44□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 PET8YNL003C 855 nt10.44□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 SDH5YOL071W 489 nt10.44□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 GLR1YPL091W 1452 nt10.43□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 RAD23YEL037C 1197 nt10.43□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 MUP1YGR055W 1725 nt10.41□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.41□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 OXA1YER154W 1209 nt10.4□□□□□ -0.74
VMS1Q04311 YMR244WYMR244W 1068 nt10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.3 ms