Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH2Q02577 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLH2Q02577 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH2Q02577 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH2Q02577 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH2Q02577 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH2Q02577 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NHLH2Q02577 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms