Protein–RNA interactions for Protein: Q00578

SSL2, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSL2Q00578 MIR1YJR077C 936 nt11.01□□□□□ -0.65
SSL2Q00578 NDI1YML120C 1542 nt11□□□□□ -0.65
SSL2Q00578 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.99□□□□□ -0.65
SSL2Q00578 TOM6YOR045W 186 nt10.99□□□□□ -0.65
SSL2Q00578 ATG15YCR068W 1563 nt10.97□□□□□ -0.65
SSL2Q00578 PAU7YAR020C 168 nt10.96□□□□□ -0.65
SSL2Q00578 DIF1YLR437C 402 nt10.96□□□□□ -0.65
SSL2Q00578 SPT20YOL148C 1815 nt10.94□□□□□ -0.66
SSL2Q00578 YDR094WYDR094W 336 nt10.94□□□□□ -0.66
SSL2Q00578 RET2YFR051C 1641 nt10.94□□□□□ -0.66
SSL2Q00578 DBP1YPL119C 1854 nt10.92□□□□□ -0.66
SSL2Q00578 PAU16YKL224C 372 nt10.92□□□□□ -0.66
SSL2Q00578 UBA4YHR111W 1323 nt10.89□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 YJL067WYJL067W 351 nt10.89□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 TIF6YPR016C 738 nt10.89□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 INA1YLR413W 2028 nt10.89□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 PEX2YJL210W 816 nt10.88□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 YML089CYML089C 369 nt10.87□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 PHO89YBR296C 1725 nt10.87□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 COQ2YNR041C 1119 nt10.85□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 ZRT3YKL175W 1512 nt10.84□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 RRT5YFR032C 870 nt10.84□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 HIP1YGR191W 1812 nt10.84□□□□□ -0.67
SSL2Q00578 SHY1YGR112W 1170 nt10.81□□□□□ -0.68
SSL2Q00578 SAM35YHR083W 990 nt10.81□□□□□ -0.68
SSL2Q00578 UBX6YJL048C 1191 nt10.81□□□□□ -0.68
SSL2Q00578 THI74YDR438W 1113 nt10.8□□□□□ -0.68
SSL2Q00578 YBL086CYBL086C 1401 nt10.8□□□□□ -0.68
SSL2Q00578 HXT1YHR094C 1713 nt10.8□□□□□ -0.68
SSL2Q00578 MTG2YHR168W 1557 nt10.75□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 YSR3YKR053C 1215 nt10.75□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 XYL2YLR070C 1071 nt10.75□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 ZTA1YBR046C 1005 nt10.75□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 HOL1YNR055C 1761 nt10.74□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 MUP1YGR055W 1725 nt10.73□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 YOR325WYOR325W 474 nt10.72□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 UFO1YML088W 2007 nt10.72□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 YAR028WYAR028W 705 nt10.71□□□□□ -0.69
SSL2Q00578 LIP1YMR298W 453 nt10.69□□□□□ -0.7
SSL2Q00578 YPL251WYPL251W 303 nt10.69□□□□□ -0.7
SSL2Q00578 MSF1YPR047W 1410 nt10.67□□□□□ -0.7
SSL2Q00578 SED1YDR077W 1017 nt10.66□□□□□ -0.7
SSL2Q00578 MET28YIR017C 564 nt10.66□□□□□ -0.7
SSL2Q00578 YGL034CYGL034C 366 nt10.65□□□□□ -0.7
SSL2Q00578 SBA1YKL117W 651 nt10.65□□□□□ -0.7
SSL2Q00578 LEU9YOR108W 1815 nt10.65□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 MRP20YDR405W 792 nt10.63□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 AKR2YOR034C 2250 nt10.63□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 NRT1YOR071C 1797 nt10.62□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 RPS14BYJL191W 417 nt10.61□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 ILV3YJR016C 1758 nt10.6□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 RIM8YGL045W 1629 nt10.6□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 URA6YKL024C 615 nt10.6□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 NAT4YMR069W 858 nt10.6□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 AIM45YPR004C 1035 nt10.6□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 BRR1YPR057W 1026 nt10.59□□□□□ -0.71
SSL2Q00578 YNL024CYNL024C 741 nt10.58□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 YCR087WYCR087W 516 nt10.57□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 RPL4BYDR012W 1089 nt10.57□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 RPL4AYBR031W 1089 nt10.57□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 UTH1YKR042W 1098 nt10.56□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 GND2YGR256W 1479 nt10.55□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 HEL2YDR266C 1920 nt10.55□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 YGL114WYGL114W 2178 nt10.54□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.54□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 TOA2YKL058W 369 nt10.54□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 ACH1YBL015W 1581 nt10.54□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 ALP1YNL270C 1722 nt10.54□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 SAM1YLR180W 1149 nt10.53□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 OYE3YPL171C 1203 nt10.53□□□□□ -0.72
SSL2Q00578 LSB6YJL100W 1824 nt10.52□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 YMR103CYMR103C 363 nt10.52□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 FLR1YBR008C 1647 nt10.51□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.51□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 FMS1YMR020W 1527 nt10.5□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 UGA4YDL210W 1716 nt10.5□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.49□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.49□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 ARO8YGL202W 1503 nt10.48□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 CWC15YDR163W 528 nt10.48□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.48□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 RBG1YAL036C 1110 nt10.48□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 CCT2YIL142W 1584 nt10.48□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 CLB6YGR109C 1143 nt10.47□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 OPI10YOL032W 741 nt10.47□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 FIT3YOR383C 615 nt10.47□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 MEP3YPR138C 1470 nt10.47□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 COQ8YGL119W 1506 nt10.47□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 UGP1YKL035W 1500 nt10.47□□□□□ -0.73
SSL2Q00578 YLR279WYLR279W 390 nt10.45□□□□□ -0.74
SSL2Q00578 MSB4YOL112W 1479 nt10.44□□□□□ -0.74
SSL2Q00578 PET8YNL003C 855 nt10.44□□□□□ -0.74
SSL2Q00578 ZAP1YJL056C 2643 nt10.43□□□□□ -0.74
SSL2Q00578 SPP2YOR148C 558 nt10.42□□□□□ -0.74
SSL2Q00578 YPS3YLR121C 1527 nt10.42□□□□□ -0.74
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