Protein–RNA interactions for Protein: P53958

BOP3, Protein BOP3, yeastyeast

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BOP3P53958 SHB17YKR043C 816 nt10.56□□□□□ -0.72
BOP3P53958 TOM6YOR045W 186 nt10.54□□□□□ -0.72
BOP3P53958 SPT20YOL148C 1815 nt10.52□□□□□ -0.73
BOP3P53958 INA1YLR413W 2028 nt10.52□□□□□ -0.73
BOP3P53958 HSL7YBR133C 2484 nt10.52□□□□□ -0.73
BOP3P53958 SAM35YHR083W 990 nt10.49□□□□□ -0.73
BOP3P53958 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.49□□□□□ -0.73
BOP3P53958 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.49□□□□□ -0.73
BOP3P53958 MIR1YJR077C 936 nt10.47□□□□□ -0.73
BOP3P53958 DIF1YLR437C 402 nt10.47□□□□□ -0.73
BOP3P53958 ZRT3YKL175W 1512 nt10.45□□□□□ -0.74
BOP3P53958 PEX2YJL210W 816 nt10.45□□□□□ -0.74
BOP3P53958 RET2YFR051C 1641 nt10.44□□□□□ -0.74
BOP3P53958 YML089CYML089C 369 nt10.44□□□□□ -0.74
BOP3P53958 YJL067WYJL067W 351 nt10.43□□□□□ -0.74
BOP3P53958 PHO89YBR296C 1725 nt10.43□□□□□ -0.74
BOP3P53958 DBP1YPL119C 1854 nt10.42□□□□□ -0.74
BOP3P53958 UBA4YHR111W 1323 nt10.41□□□□□ -0.74
BOP3P53958 RRT5YFR032C 870 nt10.41□□□□□ -0.74
BOP3P53958 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.41□□□□□ -0.74
BOP3P53958 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.41□□□□□ -0.74
BOP3P53958 HXT1YHR094C 1713 nt10.41□□□□□ -0.74
BOP3P53958 YDR094WYDR094W 336 nt10.4□□□□□ -0.74
BOP3P53958 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.39□□□□□ -0.75
BOP3P53958 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.39□□□□□ -0.75
BOP3P53958 PAU16YKL224C 372 nt10.39□□□□□ -0.75
BOP3P53958 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.39□□□□□ -0.75
BOP3P53958 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.39□□□□□ -0.75
BOP3P53958 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.39□□□□□ -0.75
BOP3P53958 TIF6YPR016C 738 nt10.39□□□□□ -0.75
BOP3P53958 SHY1YGR112W 1170 nt10.36□□□□□ -0.75
BOP3P53958 COQ2YNR041C 1119 nt10.36□□□□□ -0.75
BOP3P53958 HIP1YGR191W 1812 nt10.35□□□□□ -0.75
BOP3P53958 THI74YDR438W 1113 nt10.34□□□□□ -0.75
BOP3P53958 YSR3YKR053C 1215 nt10.34□□□□□ -0.75
BOP3P53958 YBL086CYBL086C 1401 nt10.32□□□□□ -0.76
BOP3P53958 MUP1YGR055W 1725 nt10.3□□□□□ -0.76
BOP3P53958 XYL2YLR070C 1071 nt10.3□□□□□ -0.76
BOP3P53958 LIP1YMR298W 453 nt10.3□□□□□ -0.76
BOP3P53958 MTG2YHR168W 1557 nt10.27□□□□□ -0.76
BOP3P53958 YAR028WYAR028W 705 nt10.27□□□□□ -0.77
BOP3P53958 MRP20YDR405W 792 nt10.26□□□□□ -0.77
BOP3P53958 YOR325WYOR325W 474 nt10.26□□□□□ -0.77
BOP3P53958 ZTA1YBR046C 1005 nt10.26□□□□□ -0.77
BOP3P53958 HOL1YNR055C 1761 nt10.25□□□□□ -0.77
BOP3P53958 UBX6YJL048C 1191 nt10.25□□□□□ -0.77
BOP3P53958 RIM8YGL045W 1629 nt10.25□□□□□ -0.77
BOP3P53958 SED1YDR077W 1017 nt10.24□□□□□ -0.77
BOP3P53958 MET28YIR017C 564 nt10.24□□□□□ -0.77
BOP3P53958 NRT1YOR071C 1797 nt10.22□□□□□ -0.77
BOP3P53958 YNL024CYNL024C 741 nt10.22□□□□□ -0.77
BOP3P53958 MSF1YPR047W 1410 nt10.21□□□□□ -0.78
BOP3P53958 UFO1YML088W 2007 nt10.2□□□□□ -0.78
BOP3P53958 NAT4YMR069W 858 nt10.2□□□□□ -0.78
BOP3P53958 AKR2YOR034C 2250 nt10.2□□□□□ -0.78
BOP3P53958 YPL251WYPL251W 303 nt10.2□□□□□ -0.78
BOP3P53958 YGL034CYGL034C 366 nt10.19□□□□□ -0.78
BOP3P53958 TOA2YKL058W 369 nt10.19□□□□□ -0.78
BOP3P53958 URA6YKL024C 615 nt10.18□□□□□ -0.78
BOP3P53958 SAM1YLR180W 1149 nt10.18□□□□□ -0.78
BOP3P53958 BRR1YPR057W 1026 nt10.18□□□□□ -0.78
BOP3P53958 LEU9YOR108W 1815 nt10.17□□□□□ -0.78
BOP3P53958 YCR087WYCR087W 516 nt10.16□□□□□ -0.78
BOP3P53958 ILV3YJR016C 1758 nt10.16□□□□□ -0.78
BOP3P53958 GND2YGR256W 1479 nt10.16□□□□□ -0.78
BOP3P53958 CWC15YDR163W 528 nt10.15□□□□□ -0.78
BOP3P53958 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.15□□□□□ -0.78
BOP3P53958 UTH1YKR042W 1098 nt10.15□□□□□ -0.78
BOP3P53958 AIM45YPR004C 1035 nt10.15□□□□□ -0.78
BOP3P53958 RPL4BYDR012W 1089 nt10.14□□□□□ -0.79
BOP3P53958 SBA1YKL117W 651 nt10.14□□□□□ -0.79
BOP3P53958 RPL4AYBR031W 1089 nt10.14□□□□□ -0.79
BOP3P53958 ALP1YNL270C 1722 nt10.13□□□□□ -0.79
BOP3P53958 RPS14BYJL191W 417 nt10.13□□□□□ -0.79
BOP3P53958 HEL2YDR266C 1920 nt10.13□□□□□ -0.79
BOP3P53958 CLB6YGR109C 1143 nt10.12□□□□□ -0.79
BOP3P53958 OYE3YPL171C 1203 nt10.12□□□□□ -0.79
BOP3P53958 YMR103CYMR103C 363 nt10.11□□□□□ -0.79
BOP3P53958 YGL114WYGL114W 2178 nt10.1□□□□□ -0.79
BOP3P53958 RBG1YAL036C 1110 nt10.08□□□□□ -0.8
BOP3P53958 MEP3YPR138C 1470 nt10.08□□□□□ -0.8
BOP3P53958 PET8YNL003C 855 nt10.07□□□□□ -0.8
BOP3P53958 CCT2YIL142W 1584 nt10.06□□□□□ -0.8
BOP3P53958 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.06□□□□□ -0.8
BOP3P53958 FIT3YOR383C 615 nt10.06□□□□□ -0.8
BOP3P53958 BET2YPR176C 978 nt10.05□□□□□ -0.8
BOP3P53958 ARO8YGL202W 1503 nt10.05□□□□□ -0.8
BOP3P53958 FMS1YMR020W 1527 nt10.05□□□□□ -0.8
BOP3P53958 COQ8YGL119W 1506 nt10.04□□□□□ -0.8
BOP3P53958 SPP2YOR148C 558 nt10.04□□□□□ -0.8
BOP3P53958 FLR1YBR008C 1647 nt10.04□□□□□ -0.8
BOP3P53958 OPI10YOL032W 741 nt10.03□□□□□ -0.8
BOP3P53958 ACH1YBL015W 1581 nt10.02□□□□□ -0.81
BOP3P53958 RPM1RPM1 483 nt10.02□□□□□ -0.81
BOP3P53958 UGA4YDL210W 1716 nt10.01□□□□□ -0.81
BOP3P53958 LSB6YJL100W 1824 nt10□□□□□ -0.81
BOP3P53958 RSC8YFR037C 1674 nt10□□□□□ -0.81
BOP3P53958 UGP1YKL035W 1500 nt9.99□□□□□ -0.81
BOP3P53958 SAM2YDR502C 1155 nt9.98□□□□□ -0.81
BOP3P53958 YPS3YLR121C 1527 nt9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms