Protein–RNA interactions for Protein: P53840

TOF1, Topoisomerase 1-associated factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOF1P53840 NDI1YML120C 1542 nt10.96□□□□□ -0.65
TOF1P53840 MRP20YDR405W 792 nt10.96□□□□□ -0.65
TOF1P53840 POM34YLR018C 900 nt10.94□□□□□ -0.66
TOF1P53840 YMR244WYMR244W 1068 nt10.93□□□□□ -0.66
TOF1P53840 ARP6YLR085C 1317 nt10.92□□□□□ -0.66
TOF1P53840 RTN2YDL204W 1182 nt10.92□□□□□ -0.66
TOF1P53840 LSC2YGR244C 1284 nt10.91□□□□□ -0.66
TOF1P53840 IRC24YIR036C 792 nt10.91□□□□□ -0.66
TOF1P53840 GLR1YPL091W 1452 nt10.91□□□□□ -0.66
TOF1P53840 MCH5YOR306C 1566 nt10.9□□□□□ -0.66
TOF1P53840 PRO1YDR300C 1287 nt10.9□□□□□ -0.66
TOF1P53840 TOM6YOR045W 186 nt10.9□□□□□ -0.66
TOF1P53840 SNF1YDR477W 1902 nt10.9□□□□□ -0.67
TOF1P53840 RPL4BYDR012W 1089 nt10.85□□□□□ -0.67
TOF1P53840 YML089CYML089C 369 nt10.85□□□□□ -0.67
TOF1P53840 RPL4AYBR031W 1089 nt10.85□□□□□ -0.67
TOF1P53840 HIP1YGR191W 1812 nt10.84□□□□□ -0.67
TOF1P53840 PLB1YMR008C 1995 nt10.83□□□□□ -0.68
TOF1P53840 PEX2YJL210W 816 nt10.83□□□□□ -0.68
TOF1P53840 RPS14BYJL191W 417 nt10.82□□□□□ -0.68
TOF1P53840 BIO5YNR056C 1686 nt10.82□□□□□ -0.68
TOF1P53840 ATG15YCR068W 1563 nt10.8□□□□□ -0.68
TOF1P53840 GAP1YKR039W 1809 nt10.79□□□□□ -0.68
TOF1P53840 CLB6YGR109C 1143 nt10.79□□□□□ -0.68
TOF1P53840 TIF6YPR016C 738 nt10.79□□□□□ -0.68
TOF1P53840 UTH1YKR042W 1098 nt10.78□□□□□ -0.68
TOF1P53840 NRT1YOR071C 1797 nt10.73□□□□□ -0.69
TOF1P53840 RBG2YGR173W 1107 nt10.72□□□□□ -0.69
TOF1P53840 MET28YIR017C 564 nt10.72□□□□□ -0.69
TOF1P53840 NAR1YNL240C 1476 nt10.69□□□□□ -0.7
TOF1P53840 UTR1YJR049C 1593 nt10.69□□□□□ -0.7
TOF1P53840 YMR226CYMR226C 804 nt10.67□□□□□ -0.7
TOF1P53840 DIF1YLR437C 402 nt10.65□□□□□ -0.7
TOF1P53840 SDH5YOL071W 489 nt10.65□□□□□ -0.7
TOF1P53840 TSC10YBR265W 963 nt10.65□□□□□ -0.7
TOF1P53840 PBP1YGR178C 2169 nt10.65□□□□□ -0.71
TOF1P53840 CYT2YKL087C 675 nt10.62□□□□□ -0.71
TOF1P53840 YLR111WYLR111W 333 nt10.62□□□□□ -0.71
TOF1P53840 CAB5YDR196C 726 nt10.61□□□□□ -0.71
TOF1P53840 RAD23YEL037C 1197 nt10.61□□□□□ -0.71
TOF1P53840 YGR012WYGR012W 1182 nt10.61□□□□□ -0.71
TOF1P53840 PRM5YIL117C 957 nt10.61□□□□□ -0.71
TOF1P53840 YLR279WYLR279W 390 nt10.61□□□□□ -0.71
TOF1P53840 FIT3YOR383C 615 nt10.6□□□□□ -0.71
TOF1P53840 YAR028WYAR028W 705 nt10.57□□□□□ -0.72
TOF1P53840 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.55□□□□□ -0.72
TOF1P53840 MTG2YHR168W 1557 nt10.55□□□□□ -0.72
TOF1P53840 MSB4YOL112W 1479 nt10.55□□□□□ -0.72
TOF1P53840 ALD4YOR374W 1560 nt10.54□□□□□ -0.72
TOF1P53840 ZTA1YBR046C 1005 nt10.54□□□□□ -0.72
TOF1P53840 HIF1YLL022C 1158 nt10.53□□□□□ -0.72
TOF1P53840 SAM35YHR083W 990 nt10.52□□□□□ -0.73
TOF1P53840 RPM1RPM1 483 nt10.52□□□□□ -0.73
TOF1P53840 RIB3YDR487C 627 nt10.51□□□□□ -0.73
TOF1P53840 ALP1YNL270C 1722 nt10.5□□□□□ -0.73
TOF1P53840 AKR2YOR034C 2250 nt10.49□□□□□ -0.73
TOF1P53840 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
TOF1P53840 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
TOF1P53840 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
TOF1P53840 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
TOF1P53840 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
TOF1P53840 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.43□□□□□ -0.74
TOF1P53840 SED1YDR077W 1017 nt10.42□□□□□ -0.74
TOF1P53840 SAM1YLR180W 1149 nt10.42□□□□□ -0.74
TOF1P53840 DBP1YPL119C 1854 nt10.42□□□□□ -0.74
TOF1P53840 LIP1YMR298W 453 nt10.37□□□□□ -0.75
TOF1P53840 YAT1YAR035W 2064 nt10.36□□□□□ -0.75
TOF1P53840 YBL086CYBL086C 1401 nt10.35□□□□□ -0.75
TOF1P53840 HXT1YHR094C 1713 nt10.35□□□□□ -0.75
TOF1P53840 GND1YHR183W 1470 nt10.35□□□□□ -0.75
TOF1P53840 FCY21YER060W 1587 nt10.35□□□□□ -0.75
TOF1P53840 YPL251WYPL251W 303 nt10.33□□□□□ -0.76
TOF1P53840 LOT5YKL183W 921 nt10.32□□□□□ -0.76
TOF1P53840 UGA4YDL210W 1716 nt10.32□□□□□ -0.76
TOF1P53840 ZRT3YKL175W 1512 nt10.32□□□□□ -0.76
TOF1P53840 LEU9YOR108W 1815 nt10.3□□□□□ -0.76
TOF1P53840 SMM1YNR015W 1155 nt10.29□□□□□ -0.76
TOF1P53840 APT2YDR441C 546 nt10.27□□□□□ -0.77
TOF1P53840 YPI1YFR003C 468 nt10.26□□□□□ -0.77
TOF1P53840 BRR1YPR057W 1026 nt10.26□□□□□ -0.77
TOF1P53840 ADH1YOL086C 1047 nt10.25□□□□□ -0.77
TOF1P53840 SHY1YGR112W 1170 nt10.24□□□□□ -0.77
TOF1P53840 YNR029CYNR029C 1290 nt10.24□□□□□ -0.77
TOF1P53840 PRY1YJL079C 900 nt10.23□□□□□ -0.77
TOF1P53840 INA1YLR413W 2028 nt10.23□□□□□ -0.77
TOF1P53840 CMP2YML057W 1815 nt10.22□□□□□ -0.77
TOF1P53840 UFO1YML088W 2007 nt10.21□□□□□ -0.77
TOF1P53840 TOA2YKL058W 369 nt10.21□□□□□ -0.77
TOF1P53840 YMR103CYMR103C 363 nt10.21□□□□□ -0.77
TOF1P53840 MEP3YPR138C 1470 nt10.21□□□□□ -0.78
TOF1P53840 YJL067WYJL067W 351 nt10.19□□□□□ -0.78
TOF1P53840 YJL195CYJL195C 702 nt10.18□□□□□ -0.78
TOF1P53840 RPC82YPR190C 1965 nt10.17□□□□□ -0.78
TOF1P53840 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.17□□□□□ -0.78
TOF1P53840 HSL7YBR133C 2484 nt10.16□□□□□ -0.78
TOF1P53840 HXT12YIL170W 1374 nt10.16□□□□□ -0.78
TOF1P53840 FUN14YAL008W 597 nt10.16□□□□□ -0.78
TOF1P53840 GND2YGR256W 1479 nt10.16□□□□□ -0.78
TOF1P53840 SPT20YOL148C 1815 nt10.15□□□□□ -0.78
TOF1P53840 CSM1YCR086W 573 nt10.15□□□□□ -0.78
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