Protein–RNA interactions for Protein: P53819

YRF1-6, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-6P53819 GPN2YOR262W 1044 nt12.78□□□□□ -0.36
YRF1-6P53819 PEX2YJL210W 816 nt12.77□□□□□ -0.37
YRF1-6P53819 CLB6YGR109C 1143 nt12.76□□□□□ -0.37
YRF1-6P53819 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.75□□□□□ -0.37
YRF1-6P53819 UTH1YKR042W 1098 nt12.72□□□□□ -0.37
YRF1-6P53819 YFL054CYFL054C 1941 nt12.7□□□□□ -0.38
YRF1-6P53819 YJL195CYJL195C 702 nt12.69□□□□□ -0.38
YRF1-6P53819 TIR3YIL011W 810 nt12.68□□□□□ -0.38
YRF1-6P53819 PTK1YKL198C 1989 nt12.66□□□□□ -0.38
YRF1-6P53819 CCA1YER168C 1641 nt12.65□□□□□ -0.38
YRF1-6P53819 HIP1YGR191W 1812 nt12.64□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 NBP35YGL091C 987 nt12.63□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 AQY2YLL052C 450 nt12.63□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 AAC1YMR056C 930 nt12.63□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 LOT5YKL183W 921 nt12.62□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 RAX1YOR301W 1308 nt12.62□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 CPD1YGR247W 720 nt12.61□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 RIB3YDR487C 627 nt12.61□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 SEN2YLR105C 1134 nt12.59□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 TIF6YPR016C 738 nt12.59□□□□□ -0.39
YRF1-6P53819 ESS1YJR017C 513 nt12.58□□□□□ -0.4
YRF1-6P53819 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.57□□□□□ -0.4
YRF1-6P53819 ZTA1YBR046C 1005 nt12.55□□□□□ -0.4
YRF1-6P53819 POM34YLR018C 900 nt12.54□□□□□ -0.4
YRF1-6P53819 PUP1YOR157C 786 nt12.54□□□□□ -0.4
YRF1-6P53819 YPI1YFR003C 468 nt12.53□□□□□ -0.4
YRF1-6P53819 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.52□□□□□ -0.4
YRF1-6P53819 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.52□□□□□ -0.4
YRF1-6P53819 ATG15YCR068W 1563 nt12.51□□□□□ -0.41
YRF1-6P53819 YEL008WYEL008W 381 nt12.51□□□□□ -0.41
YRF1-6P53819 PRO1YDR300C 1287 nt12.46□□□□□ -0.42
YRF1-6P53819 APT2YDR441C 546 nt12.46□□□□□ -0.42
YRF1-6P53819 GND1YHR183W 1470 nt12.44□□□□□ -0.42
YRF1-6P53819 SWE1YJL187C 2460 nt12.44□□□□□ -0.42
YRF1-6P53819 MET28YIR017C 564 nt12.43□□□□□ -0.42
YRF1-6P53819 RIB2YOL066C 1776 nt12.42□□□□□ -0.42
YRF1-6P53819 YML089CYML089C 369 nt12.39□□□□□ -0.43
YRF1-6P53819 AKR2YOR034C 2250 nt12.39□□□□□ -0.43
YRF1-6P53819 DUS1YML080W 1272 nt12.37□□□□□ -0.43
YRF1-6P53819 LSC2YGR244C 1284 nt12.36□□□□□ -0.43
YRF1-6P53819 STR3YGL184C 1398 nt12.36□□□□□ -0.43
YRF1-6P53819 SMM1YNR015W 1155 nt12.34□□□□□ -0.43
YRF1-6P53819 FIT3YOR383C 615 nt12.34□□□□□ -0.43
YRF1-6P53819 PAU5YFL020C 369 nt12.32□□□□□ -0.44
YRF1-6P53819 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.31□□□□□ -0.44
YRF1-6P53819 ALD4YOR374W 1560 nt12.31□□□□□ -0.44
YRF1-6P53819 NAP1YKR048C 1254 nt12.3□□□□□ -0.44
YRF1-6P53819 PGC1YPL206C 966 nt12.3□□□□□ -0.44
YRF1-6P53819 UGA4YDL210W 1716 nt12.29□□□□□ -0.44
YRF1-6P53819 YJL055WYJL055W 738 nt12.28□□□□□ -0.44
YRF1-6P53819 DIF1YLR437C 402 nt12.28□□□□□ -0.44
YRF1-6P53819 YCL074WYCL074W 927 nt12.25□□□□□ -0.45
YRF1-6P53819 GAP1YKR039W 1809 nt12.24□□□□□ -0.45
YRF1-6P53819 ARP6YLR085C 1317 nt12.23□□□□□ -0.45
YRF1-6P53819 YJL064WYJL064W 396 nt12.23□□□□□ -0.45
YRF1-6P53819 SLG1YOR008C 1137 nt12.22□□□□□ -0.45
YRF1-6P53819 TIP1YBR067C 633 nt12.21□□□□□ -0.46
YRF1-6P53819 PRY1YJL079C 900 nt12.2□□□□□ -0.46
YRF1-6P53819 YBR232CYBR232C 360 nt12.19□□□□□ -0.46
YRF1-6P53819 YAR028WYAR028W 705 nt12.17□□□□□ -0.46
YRF1-6P53819 FCY21YER060W 1587 nt12.17□□□□□ -0.46
YRF1-6P53819 YJR114WYJR114W 393 nt12.17□□□□□ -0.46
YRF1-6P53819 HXT12YIL170W 1374 nt12.16□□□□□ -0.46
YRF1-6P53819 PLB1YMR008C 1995 nt12.16□□□□□ -0.46
YRF1-6P53819 PAU19YMR325W 375 nt12.14□□□□□ -0.47
YRF1-6P53819 MTG2YHR168W 1557 nt12.12□□□□□ -0.47
YRF1-6P53819 RTN2YDL204W 1182 nt12.11□□□□□ -0.47
YRF1-6P53819 VRG4YGL225W 1014 nt12.11□□□□□ -0.47
YRF1-6P53819 UTR1YJR049C 1593 nt12.09□□□□□ -0.47
YRF1-6P53819 ALP1YNL270C 1722 nt12.08□□□□□ -0.48
YRF1-6P53819 THI72YOR192C 1800 nt12.07□□□□□ -0.48
YRF1-6P53819 CCT5YJR064W 1689 nt12.07□□□□□ -0.48
YRF1-6P53819 HSP60YLR259C 1719 nt12.04□□□□□ -0.48
YRF1-6P53819 MEP3YPR138C 1470 nt12.02□□□□□ -0.49
YRF1-6P53819 YJL118WYJL118W 660 nt12.01□□□□□ -0.49
YRF1-6P53819 ERG6YML008C 1152 nt12□□□□□ -0.49
YRF1-6P53819 TIM44YIL022W 1296 nt11.97□□□□□ -0.49
YRF1-6P53819 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 PRM5YIL117C 957 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 STP3YLR375W 1032 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 SNZ1YMR096W 894 nt11.91□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 SED1YDR077W 1017 nt11.91□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 LSB5YCL034W 1065 nt11.9□□□□□ -0.5
YRF1-6P53819 FUR4YBR021W 1902 nt11.89□□□□□ -0.51
YRF1-6P53819 GAL3YDR009W 1563 nt11.86□□□□□ -0.51
YRF1-6P53819 POP2YNR052C 1302 nt11.84□□□□□ -0.51
YRF1-6P53819 YGR259CYGR259C 441 nt11.83□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 CSM1YCR086W 573 nt11.81□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 TAF13YML098W 504 nt11.81□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 YPL251WYPL251W 303 nt11.81□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 YKR005CYKR005C 1578 nt11.81□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 RIB1YBL033C 1038 nt11.8□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 YMR262WYMR262W 942 nt11.79□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 LIP1YMR298W 453 nt11.79□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 APS2YJR058C 444 nt11.78□□□□□ -0.52
YRF1-6P53819 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.9 ms