Protein–RNA interactions for Protein: P53292

MRPS35, 37S ribosomal protein S35, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPS35P53292 PEX2YJL210W 816 nt11.78□□□□□ -0.52
MRPS35P53292 LSC2YGR244C 1284 nt11.75□□□□□ -0.53
MRPS35P53292 ATG15YCR068W 1563 nt11.73□□□□□ -0.53
MRPS35P53292 YMR244WYMR244W 1068 nt11.73□□□□□ -0.53
MRPS35P53292 NVJ2YPR091C 2313 nt11.71□□□□□ -0.53
MRPS35P53292 GLR1YPL091W 1452 nt11.71□□□□□ -0.53
MRPS35P53292 HIP1YGR191W 1812 nt11.71□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 GAP1YKR039W 1809 nt11.71□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 BMT6YLR063W 1098 nt11.7□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 SNF1YDR477W 1902 nt11.7□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 RPL4BYDR012W 1089 nt11.68□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 YML089CYML089C 369 nt11.68□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 RPL4AYBR031W 1089 nt11.68□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 TIF6YPR016C 738 nt11.67□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 RPS14BYJL191W 417 nt11.66□□□□□ -0.54
MRPS35P53292 UTR1YJR049C 1593 nt11.64□□□□□ -0.55
MRPS35P53292 AAC1YMR056C 930 nt11.63□□□□□ -0.55
MRPS35P53292 UTH1YKR042W 1098 nt11.61□□□□□ -0.55
MRPS35P53292 NRT1YOR071C 1797 nt11.6□□□□□ -0.55
MRPS35P53292 CLB6YGR109C 1143 nt11.6□□□□□ -0.55
MRPS35P53292 IRC24YIR036C 792 nt11.6□□□□□ -0.55
MRPS35P53292 PRM5YIL117C 957 nt11.58□□□□□ -0.56
MRPS35P53292 MET28YIR017C 564 nt11.56□□□□□ -0.56
MRPS35P53292 DIF1YLR437C 402 nt11.55□□□□□ -0.56
MRPS35P53292 SDH5YOL071W 489 nt11.54□□□□□ -0.56
MRPS35P53292 BIO5YNR056C 1686 nt11.53□□□□□ -0.56
MRPS35P53292 CAB5YDR196C 726 nt11.51□□□□□ -0.57
MRPS35P53292 RBG2YGR173W 1107 nt11.49□□□□□ -0.57
MRPS35P53292 ALG12YNR030W 1656 nt11.47□□□□□ -0.57
MRPS35P53292 ZTA1YBR046C 1005 nt11.47□□□□□ -0.57
MRPS35P53292 YGR012WYGR012W 1182 nt11.46□□□□□ -0.57
MRPS35P53292 TSC10YBR265W 963 nt11.46□□□□□ -0.57
MRPS35P53292 YLR279WYLR279W 390 nt11.45□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 YLR111WYLR111W 333 nt11.43□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 MSB4YOL112W 1479 nt11.43□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 MTG2YHR168W 1557 nt11.42□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 YAR028WYAR028W 705 nt11.42□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
MRPS35P53292 HIF1YLL022C 1158 nt11.39□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 YMR226CYMR226C 804 nt11.39□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 FIT3YOR383C 615 nt11.39□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 AKR2YOR034C 2250 nt11.38□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 RAD23YEL037C 1197 nt11.37□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 ALD4YOR374W 1560 nt11.37□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 SAM35YHR083W 990 nt11.36□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.35□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 ALP1YNL270C 1722 nt11.34□□□□□ -0.59
MRPS35P53292 DBP1YPL119C 1854 nt11.31□□□□□ -0.6
MRPS35P53292 RIB3YDR487C 627 nt11.29□□□□□ -0.6
MRPS35P53292 PBP1YGR178C 2169 nt11.28□□□□□ -0.6
MRPS35P53292 SED1YDR077W 1017 nt11.28□□□□□ -0.6
MRPS35P53292 LIP1YMR298W 453 nt11.25□□□□□ -0.61
MRPS35P53292 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.25□□□□□ -0.61
MRPS35P53292 HXT1YHR094C 1713 nt11.25□□□□□ -0.61
MRPS35P53292 YBL086CYBL086C 1401 nt11.25□□□□□ -0.61
MRPS35P53292 YPL251WYPL251W 303 nt11.23□□□□□ -0.61
MRPS35P53292 UGA4YDL210W 1716 nt11.22□□□□□ -0.61
MRPS35P53292 NAR1YNL240C 1476 nt11.21□□□□□ -0.61
MRPS35P53292 YJL225CYJL225C 5277 nt11.21□□□□□ -0.61
MRPS35P53292 SHY1YGR112W 1170 nt11.16□□□□□ -0.62
MRPS35P53292 GND1YHR183W 1470 nt11.15□□□□□ -0.62
MRPS35P53292 LOT5YKL183W 921 nt11.15□□□□□ -0.62
MRPS35P53292 SMM1YNR015W 1155 nt11.15□□□□□ -0.62
MRPS35P53292 BRR1YPR057W 1026 nt11.15□□□□□ -0.62
MRPS35P53292 FCY21YER060W 1587 nt11.15□□□□□ -0.62
MRPS35P53292 LEU9YOR108W 1815 nt11.14□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 SAM1YLR180W 1149 nt11.14□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 YMR103CYMR103C 363 nt11.14□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 MCH5YOR306C 1566 nt11.14□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 TOA2YKL058W 369 nt11.13□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 CYT2YKL087C 675 nt11.13□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 MEP3YPR138C 1470 nt11.12□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 APT2YDR441C 546 nt11.11□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 GND2YGR256W 1479 nt11.09□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 UME6YDR207C 2511 nt11.09□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 UFO1YML088W 2007 nt11.09□□□□□ -0.63
MRPS35P53292 PRY1YJL079C 900 nt11.08□□□□□ -0.64
MRPS35P53292 ZRT3YKL175W 1512 nt11.05□□□□□ -0.64
MRPS35P53292 YAT1YAR035W 2064 nt11.05□□□□□ -0.64
MRPS35P53292 ADH1YOL086C 1047 nt11.03□□□□□ -0.64
MRPS35P53292 YJL067WYJL067W 351 nt11.02□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 YNR029CYNR029C 1290 nt11.02□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.01□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 YPI1YFR003C 468 nt11□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 RIB2YOL066C 1776 nt11□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 URA6YKL024C 615 nt10.99□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 SSN3YPL042C 1668 nt10.98□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 CSM1YCR086W 573 nt10.98□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 YJL055WYJL055W 738 nt10.98□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 OYE3YPL171C 1203 nt10.98□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.98□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 BNI5YNL166C 1347 nt10.96□□□□□ -0.65
MRPS35P53292 YJL195CYJL195C 702 nt10.94□□□□□ -0.66
MRPS35P53292 RAD51YER095W 1203 nt10.92□□□□□ -0.66
MRPS35P53292 VRG4YGL225W 1014 nt10.92□□□□□ -0.66
MRPS35P53292 HXT12YIL170W 1374 nt10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms