Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 PRM5YIL117C 957 nt9.21□□□□□ -0.94
SYF2P53277 UTR1YJR049C 1593 nt9.2□□□□□ -0.94
SYF2P53277 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.19□□□□□ -0.94
SYF2P53277 GAP1YKR039W 1809 nt9.19□□□□□ -0.94
SYF2P53277 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.18□□□□□ -0.94
SYF2P53277 CMP2YML057W 1815 nt9.18□□□□□ -0.94
SYF2P53277 PHO89YBR296C 1725 nt9.15□□□□□ -0.94
SYF2P53277 MSF1YPR047W 1410 nt9.14□□□□□ -0.95
SYF2P53277 TOM6YOR045W 186 nt9.14□□□□□ -0.95
SYF2P53277 HIF1YLL022C 1158 nt9.13□□□□□ -0.95
SYF2P53277 COQ2YNR041C 1119 nt9.13□□□□□ -0.95
SYF2P53277 ATG15YCR068W 1563 nt9.12□□□□□ -0.95
SYF2P53277 YSR3YKR053C 1215 nt9.12□□□□□ -0.95
SYF2P53277 NAT4YMR069W 858 nt9.12□□□□□ -0.95
SYF2P53277 YML089CYML089C 369 nt9.11□□□□□ -0.95
SYF2P53277 HIP1YGR191W 1812 nt9.09□□□□□ -0.95
SYF2P53277 YAT1YAR035W 2064 nt9.09□□□□□ -0.95
SYF2P53277 DIF1YLR437C 402 nt9.08□□□□□ -0.96
SYF2P53277 TIF6YPR016C 738 nt9.08□□□□□ -0.96
SYF2P53277 ALD4YOR374W 1560 nt9.07□□□□□ -0.96
SYF2P53277 XYL2YLR070C 1071 nt9.07□□□□□ -0.96
SYF2P53277 YGL034CYGL034C 366 nt9.06□□□□□ -0.96
SYF2P53277 PEX2YJL210W 816 nt9.06□□□□□ -0.96
SYF2P53277 YCR087WYCR087W 516 nt9.02□□□□□ -0.97
SYF2P53277 AIM45YPR004C 1035 nt9.01□□□□□ -0.97
SYF2P53277 DBP1YPL119C 1854 nt9□□□□□ -0.97
SYF2P53277 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.99□□□□□ -0.97
SYF2P53277 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.99□□□□□ -0.97
SYF2P53277 MRP20YDR405W 792 nt8.99□□□□□ -0.97
SYF2P53277 NDI1YML120C 1542 nt8.98□□□□□ -0.97
SYF2P53277 SAM35YHR083W 990 nt8.96□□□□□ -0.98
SYF2P53277 RPS14BYJL191W 417 nt8.96□□□□□ -0.98
SYF2P53277 HSL7YBR133C 2484 nt8.95□□□□□ -0.98
SYF2P53277 RPL4BYDR012W 1089 nt8.94□□□□□ -0.98
SYF2P53277 MET28YIR017C 564 nt8.94□□□□□ -0.98
SYF2P53277 RPL4AYBR031W 1089 nt8.94□□□□□ -0.98
SYF2P53277 MTG2YHR168W 1557 nt8.94□□□□□ -0.98
SYF2P53277 YAR028WYAR028W 705 nt8.93□□□□□ -0.98
SYF2P53277 UTH1YKR042W 1098 nt8.92□□□□□ -0.98
SYF2P53277 ZTA1YBR046C 1005 nt8.92□□□□□ -0.98
SYF2P53277 NRT1YOR071C 1797 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF2P53277 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF2P53277 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF2P53277 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF2P53277 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF2P53277 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF2P53277 RPC82YPR190C 1965 nt8.9□□□□□ -0.98
SYF2P53277 RBG1YAL036C 1110 nt8.9□□□□□ -0.98
SYF2P53277 YBL086CYBL086C 1401 nt8.89□□□□□ -0.99
SYF2P53277 HXT1YHR094C 1713 nt8.89□□□□□ -0.99
SYF2P53277 ZRT3YKL175W 1512 nt8.87□□□□□ -0.99
SYF2P53277 CLB6YGR109C 1143 nt8.87□□□□□ -0.99
SYF2P53277 SED1YDR077W 1017 nt8.86□□□□□ -0.99
SYF2P53277 SHY1YGR112W 1170 nt8.86□□□□□ -0.99
SYF2P53277 SPT20YOL148C 1815 nt8.85□□□□□ -0.99
SYF2P53277 YJL067WYJL067W 351 nt8.85□□□□□ -0.99
SYF2P53277 LIP1YMR298W 453 nt8.84□□□□□ -0.99
SYF2P53277 AKR2YOR034C 2250 nt8.83□□□□□ -1
SYF2P53277 FIT3YOR383C 615 nt8.83□□□□□ -1
SYF2P53277 YPL251WYPL251W 303 nt8.83□□□□□ -1
SYF2P53277 UFO1YML088W 2007 nt8.82□□□□□ -1
SYF2P53277 SBA1YKL117W 651 nt8.82□□□□□ -1
SYF2P53277 ALP1YNL270C 1722 nt8.82□□□□□ -1
SYF2P53277 LEU9YOR108W 1815 nt8.82□□□□□ -1
SYF2P53277 YLR279WYLR279W 390 nt8.8□□□□□ -1
SYF2P53277 INA1YLR413W 2028 nt8.78□□□□□ -1
SYF2P53277 MSB4YOL112W 1479 nt8.77□□□□□ -1
SYF2P53277 TSC10YBR265W 963 nt8.77□□□□□ -1.01
SYF2P53277 HEL2YDR266C 1920 nt8.76□□□□□ -1.01
SYF2P53277 CAB5YDR196C 726 nt8.75□□□□□ -1.01
SYF2P53277 YGR012WYGR012W 1182 nt8.74□□□□□ -1.01
SYF2P53277 BRR1YPR057W 1026 nt8.74□□□□□ -1.01
SYF2P53277 URA6YKL024C 615 nt8.73□□□□□ -1.01
SYF2P53277 UGA4YDL210W 1716 nt8.71□□□□□ -1.01
SYF2P53277 SAM1YLR180W 1149 nt8.71□□□□□ -1.02
SYF2P53277 RPM1RPM1 483 nt8.71□□□□□ -1.02
SYF2P53277 RIM8YGL045W 1629 nt8.69□□□□□ -1.02
SYF2P53277 TOA2YKL058W 369 nt8.69□□□□□ -1.02
SYF2P53277 YMR103CYMR103C 363 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF2P53277 SDH5YOL071W 489 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF2P53277 GLR1YPL091W 1452 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF2P53277 GND2YGR256W 1479 nt8.67□□□□□ -1.02
SYF2P53277 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.67□□□□□ -1.02
SYF2P53277 OYE3YPL171C 1203 nt8.67□□□□□ -1.02
SYF2P53277 FCY21YER060W 1587 nt8.65□□□□□ -1.02
SYF2P53277 MEP3YPR138C 1470 nt8.65□□□□□ -1.02
SYF2P53277 YMR244WYMR244W 1068 nt8.64□□□□□ -1.03
SYF2P53277 RAD23YEL037C 1197 nt8.63□□□□□ -1.03
SYF2P53277 YOR325WYOR325W 474 nt8.63□□□□□ -1.03
SYF2P53277 FLR1YBR008C 1647 nt8.62□□□□□ -1.03
SYF2P53277 ILV3YJR016C 1758 nt8.62□□□□□ -1.03
SYF2P53277 ACH1YBL015W 1581 nt8.61□□□□□ -1.03
SYF2P53277 HOL1YNR055C 1761 nt8.61□□□□□ -1.03
SYF2P53277 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.61□□□□□ -1.03
SYF2P53277 YGL114WYGL114W 2178 nt8.61□□□□□ -1.03
SYF2P53277 PET8YNL003C 855 nt8.6□□□□□ -1.03
SYF2P53277 FMS1YMR020W 1527 nt8.59□□□□□ -1.03
SYF2P53277 RIB3YDR487C 627 nt8.58□□□□□ -1.04
SYF2P53277 MUP1YGR055W 1725 nt8.57□□□□□ -1.04
SYF2P53277 SSN3YPL042C 1668 nt8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms