Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTDSS1P48651 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTDSS1P48651 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTDSS1P48651 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTDSS1P48651 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTDSS1P48651 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTDSS1P48651 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTDSS1P48651 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTDSS1P48651 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTDSS1P48651 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTDSS1P48651 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTDSS1P48651 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTDSS1P48651 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTDSS1P48651 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1P48651 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTDSS1P48651 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTDSS1P48651 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTDSS1P48651 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTDSS1P48651 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTDSS1P48651 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms