Protein–RNA interactions for Protein: P38255

RXT2, Transcriptional regulatory protein RXT2, yeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RXT2	P38255	ARP6	YLR085C	1317 nt		11.32	□□□□□ -0.6
RXT2	P38255	LSC2	YGR244C	1284 nt		11.29	□□□□□ -0.6
RXT2	P38255	DPS1	YLL018C	1674 nt		11.29	□□□□□ -0.6
RXT2	P38255	PLB1	YMR008C	1995 nt		11.28	□□□□□ -0.6
RXT2	P38255	PEX2	YJL210W	816 nt		11.27	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	GLR1	YPL091W	1452 nt		11.26	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	ATG15	YCR068W	1563 nt		11.25	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	BMT6	YLR063W	1098 nt		11.25	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	YML089C	YML089C	369 nt		11.24	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	YMR244W	YMR244W	1068 nt		11.24	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	RPL4B	YDR012W	1089 nt		11.23	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	RPL4A	YBR031W	1089 nt		11.23	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	HIP1	YGR191W	1812 nt		11.22	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	GAP1	YKR039W	1809 nt		11.22	□□□□□ -0.61
RXT2	P38255	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		11.2	□□□□□ -0.62
RXT2	P38255	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		11.2	□□□□□ -0.62
RXT2	P38255	CLB6	YGR109C	1143 nt		11.19	□□□□□ -0.62
RXT2	P38255	RPS14B	YJL191W	417 nt		11.18	□□□□□ -0.62
RXT2	P38255	TIF6	YPR016C	738 nt		11.18	□□□□□ -0.62
RXT2	P38255	UTH1	YKR042W	1098 nt		11.17	□□□□□ -0.62
RXT2	P38255	AAC1	YMR056C	930 nt		11.15	□□□□□ -0.62
RXT2	P38255	NRT1	YOR071C	1797 nt		11.14	□□□□□ -0.63
RXT2	P38255	IRC24	YIR036C	792 nt		11.13	□□□□□ -0.63
RXT2	P38255	SNF1	YDR477W	1902 nt		11.13	□□□□□ -0.63
RXT2	P38255	UTR1	YJR049C	1593 nt		11.12	□□□□□ -0.63
RXT2	P38255	MET28	YIR017C	564 nt		11.11	□□□□□ -0.63
RXT2	P38255	SDH5	YOL071W	489 nt		11.09	□□□□□ -0.63
RXT2	P38255	PRM5	YIL117C	957 nt		11.06	□□□□□ -0.64
RXT2	P38255	DIF1	YLR437C	402 nt		11.05	□□□□□ -0.64
RXT2	P38255	RBG2	YGR173W	1107 nt		11.04	□□□□□ -0.64
RXT2	P38255	YLR111W	YLR111W	333 nt		11.02	□□□□□ -0.65
RXT2	P38255	TSC10	YBR265W	963 nt		11.02	□□□□□ -0.65
RXT2	P38255	YGR012W	YGR012W	1182 nt		11	□□□□□ -0.65
RXT2	P38255	YMR226C	YMR226C	804 nt		10.99	□□□□□ -0.65
RXT2	P38255	FIT3	YOR383C	615 nt		10.98	□□□□□ -0.65
RXT2	P38255	BIO5	YNR056C	1686 nt		10.98	□□□□□ -0.65
RXT2	P38255	YAR028W	YAR028W	705 nt		10.97	□□□□□ -0.65
RXT2	P38255	YLR279W	YLR279W	390 nt		10.96	□□□□□ -0.65
RXT2	P38255	FRE6	YLL051C	2139 nt		10.96	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	RAD23	YEL037C	1197 nt		10.95	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	SAM35	YHR083W	990 nt		10.95	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	ZTA1	YBR046C	1005 nt		10.95	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	ALG12	YNR030W	1656 nt		10.95	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	CAB5	YDR196C	726 nt		10.94	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	MTG2	YHR168W	1557 nt		10.93	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	MSB4	YOL112W	1479 nt		10.93	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	AKR2	YOR034C	2250 nt		10.92	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	ALD4	YOR374W	1560 nt		10.9	□□□□□ -0.66
RXT2	P38255	ALP1	YNL270C	1722 nt		10.89	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	YER190C-A	YER190C-A	576 nt		10.88	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	YGR296C-A	YGR296C-A	576 nt		10.88	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	HIF1	YLL022C	1158 nt		10.88	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	YML133W-A	YML133W-A	576 nt		10.88	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	YNL339W-A	YNL339W-A	576 nt		10.88	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	YPL283W-A	YPL283W-A	576 nt		10.88	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	YLR437C-A	YLR437C-A	228 nt		10.87	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	RIB3	YDR487C	627 nt		10.85	□□□□□ -0.67
RXT2	P38255	SED1	YDR077W	1017 nt		10.83	□□□□□ -0.68
RXT2	P38255	YPL222C-A	YPL222C-A	246 nt		10.82	□□□□□ -0.68
RXT2	P38255	LIP1	YMR298W	453 nt		10.81	□□□□□ -0.68
RXT2	P38255	UME6	YDR207C	2511 nt		10.81	□□□□□ -0.68
RXT2	P38255	DBP1	YPL119C	1854 nt		10.81	□□□□□ -0.68
RXT2	P38255	HXT1	YHR094C	1713 nt		10.78	□□□□□ -0.68
RXT2	P38255	YBL086C	YBL086C	1401 nt		10.75	□□□□□ -0.69
RXT2	P38255	SAM1	YLR180W	1149 nt		10.75	□□□□□ -0.69
RXT2	P38255	YPL251W	YPL251W	303 nt		10.73	□□□□□ -0.69
RXT2	P38255	PBP1	YGR178C	2169 nt		10.73	□□□□□ -0.69
RXT2	P38255	UGA4	YDL210W	1716 nt		10.71	□□□□□ -0.69
RXT2	P38255	GND1	YHR183W	1470 nt		10.7	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	NAR1	YNL240C	1476 nt		10.7	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	LOT5	YKL183W	921 nt		10.7	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	FCY21	YER060W	1587 nt		10.69	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	BRR1	YPR057W	1026 nt		10.68	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	SHY1	YGR112W	1170 nt		10.67	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	TOA2	YKL058W	369 nt		10.67	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	SMM1	YNR015W	1155 nt		10.67	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	LEU9	YOR108W	1815 nt		10.67	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	CYT2	YKL087C	675 nt		10.65	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	MEP3	YPR138C	1470 nt		10.65	□□□□□ -0.7
RXT2	P38255	YMR103C	YMR103C	363 nt		10.64	□□□□□ -0.71
RXT2	P38255	APT2	YDR441C	546 nt		10.63	□□□□□ -0.71
RXT2	P38255	PRY1	YJL079C	900 nt		10.61	□□□□□ -0.71
RXT2	P38255	ZRT3	YKL175W	1512 nt		10.61	□□□□□ -0.71
RXT2	P38255	GND2	YGR256W	1479 nt		10.61	□□□□□ -0.71
RXT2	P38255	YPI1	YFR003C	468 nt		10.6	□□□□□ -0.71
RXT2	P38255	UFO1	YML088W	2007 nt		10.59	□□□□□ -0.71
RXT2	P38255	MCH5	YOR306C	1566 nt		10.58	□□□□□ -0.72
RXT2	P38255	ADH1	YOL086C	1047 nt		10.58	□□□□□ -0.72
RXT2	P38255	TRT2	tT(CGU)K	72 nt		10.56	□□□□□ -0.72
RXT2	P38255	YNR029C	YNR029C	1290 nt		10.56	□□□□□ -0.72
RXT2	P38255	LSB3	YFR024C-A	1380 nt		10.55	□□□□□ -0.72
RXT2	P38255	SSN3	YPL042C	1668 nt		10.53	□□□□□ -0.72
RXT2	P38255	URA6	YKL024C	615 nt		10.53	□□□□□ -0.72
RXT2	P38255	YJL067W	YJL067W	351 nt		10.52	□□□□□ -0.73
RXT2	P38255	RIB2	YOL066C	1776 nt		10.52	□□□□□ -0.73
RXT2	P38255	YJL195C	YJL195C	702 nt		10.51	□□□□□ -0.73
RXT2	P38255	OYE3	YPL171C	1203 nt		10.51	□□□□□ -0.73
RXT2	P38255	CSM1	YCR086W	573 nt		10.5	□□□□□ -0.73
RXT2	P38255	VRG4	YGL225W	1014 nt		10.49	□□□□□ -0.73
RXT2	P38255	YJL055W	YJL055W	738 nt		10.49	□□□□□ -0.73

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.3 ms