Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX2P28328 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX2P28328 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX2P28328 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX2P28328 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PEX2P28328 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PEX2P28328 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PEX2P28328 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX2P28328 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX2P28328 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX2P28328 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX2P28328 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX2P28328 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX2P28328 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX2P28328 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX2P28328 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX2P28328 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX2P28328 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX2P28328 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PEX2P28328 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX2P28328 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX2P28328 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX2P28328 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX2P28328 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX2P28328 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX2P28328 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PEX2P28328 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX2P28328 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX2P28328 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX2P28328 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX2P28328 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX2P28328 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX2P28328 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX2P28328 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX2P28328 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX2P28328 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX2P28328 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX2P28328 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX2P28328 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX2P28328 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX2P28328 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX2P28328 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX2P28328 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX2P28328 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX2P28328 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX2P28328 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX2P28328 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX2P28328 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX2P28328 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX2P28328 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX2P28328 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX2P28328 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX2P28328 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX2P28328 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX2P28328 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX2P28328 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX2P28328 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX2P28328 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX2P28328 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX2P28328 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX2P28328 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX2P28328 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX2P28328 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX2P28328 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX2P28328 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX2P28328 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX2P28328 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX2P28328 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PEX2P28328 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PEX2P28328 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX2P28328 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX2P28328 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX2P28328 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX2P28328 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX2P28328 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX2P28328 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX2P28328 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX2P28328 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX2P28328 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX2P28328 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX2P28328 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX2P28328 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX2P28328 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX2P28328 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX2P28328 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX2P28328 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX2P28328 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX2P28328 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX2P28328 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX2P28328 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX2P28328 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX2P28328 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX2P28328 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX2P28328 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX2P28328 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX2P28328 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX2P28328 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX2P28328 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX2P28328 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX2P28328 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms