Protein–RNA interactions for Protein: P25359

RRP43, Exosome complex component RRP43, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP43P25359 MIR1YJR077C 936 nt10.72□□□□□ -0.69
RRP43P25359 CMP2YML057W 1815 nt10.72□□□□□ -0.69
RRP43P25359 YDR094WYDR094W 336 nt10.71□□□□□ -0.69
RRP43P25359 RPC82YPR190C 1965 nt10.69□□□□□ -0.7
RRP43P25359 NDI1YML120C 1542 nt10.68□□□□□ -0.7
RRP43P25359 PAU7YAR020C 168 nt10.68□□□□□ -0.7
RRP43P25359 RET2YFR051C 1641 nt10.67□□□□□ -0.7
RRP43P25359 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.66□□□□□ -0.7
RRP43P25359 ATG15YCR068W 1563 nt10.65□□□□□ -0.7
RRP43P25359 DIF1YLR437C 402 nt10.65□□□□□ -0.7
RRP43P25359 YML089CYML089C 369 nt10.65□□□□□ -0.7
RRP43P25359 TOM6YOR045W 186 nt10.64□□□□□ -0.71
RRP43P25359 DBP1YPL119C 1854 nt10.62□□□□□ -0.71
RRP43P25359 PAU16YKL224C 372 nt10.62□□□□□ -0.71
RRP43P25359 SPT20YOL148C 1815 nt10.61□□□□□ -0.71
RRP43P25359 RRT5YFR032C 870 nt10.61□□□□□ -0.71
RRP43P25359 UBA4YHR111W 1323 nt10.6□□□□□ -0.71
RRP43P25359 SAM35YHR083W 990 nt10.59□□□□□ -0.71
RRP43P25359 TIF6YPR016C 738 nt10.59□□□□□ -0.71
RRP43P25359 RPM1RPM1 483 nt10.58□□□□□ -0.72
RRP43P25359 ZRT3YKL175W 1512 nt10.58□□□□□ -0.72
RRP43P25359 INA1YLR413W 2028 nt10.57□□□□□ -0.72
RRP43P25359 HIP1YGR191W 1812 nt10.56□□□□□ -0.72
RRP43P25359 PHO89YBR296C 1725 nt10.55□□□□□ -0.72
RRP43P25359 COQ2YNR041C 1119 nt10.54□□□□□ -0.72
RRP43P25359 THI74YDR438W 1113 nt10.53□□□□□ -0.72
RRP43P25359 PEX2YJL210W 816 nt10.53□□□□□ -0.72
RRP43P25359 YJL067WYJL067W 351 nt10.52□□□□□ -0.73
RRP43P25359 UBX6YJL048C 1191 nt10.5□□□□□ -0.73
RRP43P25359 HXT1YHR094C 1713 nt10.5□□□□□ -0.73
RRP43P25359 YSR3YKR053C 1215 nt10.48□□□□□ -0.73
RRP43P25359 SHY1YGR112W 1170 nt10.47□□□□□ -0.73
RRP43P25359 YBL086CYBL086C 1401 nt10.47□□□□□ -0.73
RRP43P25359 MTG2YHR168W 1557 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP43P25359 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP43P25359 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP43P25359 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP43P25359 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP43P25359 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP43P25359 YAR028WYAR028W 705 nt10.44□□□□□ -0.74
RRP43P25359 MSF1YPR047W 1410 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP43P25359 MET28YIR017C 564 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP43P25359 XYL2YLR070C 1071 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP43P25359 UFO1YML088W 2007 nt10.4□□□□□ -0.75
RRP43P25359 YCR087WYCR087W 516 nt10.39□□□□□ -0.75
RRP43P25359 SED1YDR077W 1017 nt10.39□□□□□ -0.75
RRP43P25359 LIP1YMR298W 453 nt10.39□□□□□ -0.75
RRP43P25359 MRP20YDR405W 792 nt10.38□□□□□ -0.75
RRP43P25359 NAT4YMR069W 858 nt10.38□□□□□ -0.75
RRP43P25359 ZTA1YBR046C 1005 nt10.38□□□□□ -0.75
RRP43P25359 YGL034CYGL034C 366 nt10.37□□□□□ -0.75
RRP43P25359 LEU9YOR108W 1815 nt10.37□□□□□ -0.75
RRP43P25359 HOL1YNR055C 1761 nt10.37□□□□□ -0.75
RRP43P25359 NRT1YOR071C 1797 nt10.35□□□□□ -0.75
RRP43P25359 AIM45YPR004C 1035 nt10.35□□□□□ -0.75
RRP43P25359 RPL4BYDR012W 1089 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP43P25359 RPS14BYJL191W 417 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP43P25359 RPL4AYBR031W 1089 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP43P25359 YPL251WYPL251W 303 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP43P25359 UTH1YKR042W 1098 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP43P25359 URA6YKL024C 615 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP43P25359 ILV3YJR016C 1758 nt10.31□□□□□ -0.76
RRP43P25359 MUP1YGR055W 1725 nt10.31□□□□□ -0.76
RRP43P25359 AKR2YOR034C 2250 nt10.3□□□□□ -0.76
RRP43P25359 YOR325WYOR325W 474 nt10.3□□□□□ -0.76
RRP43P25359 ALP1YNL270C 1722 nt10.3□□□□□ -0.76
RRP43P25359 CLB6YGR109C 1143 nt10.28□□□□□ -0.76
RRP43P25359 SBA1YKL117W 651 nt10.28□□□□□ -0.76
RRP43P25359 FIT3YOR383C 615 nt10.28□□□□□ -0.76
RRP43P25359 BRR1YPR057W 1026 nt10.27□□□□□ -0.77
RRP43P25359 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP43P25359 SAM1YLR180W 1149 nt10.24□□□□□ -0.77
RRP43P25359 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.22□□□□□ -0.77
RRP43P25359 OYE3YPL171C 1203 nt10.22□□□□□ -0.77
RRP43P25359 YGL114WYGL114W 2178 nt10.22□□□□□ -0.77
RRP43P25359 TOA2YKL058W 369 nt10.21□□□□□ -0.77
RRP43P25359 YNL024CYNL024C 741 nt10.2□□□□□ -0.78
RRP43P25359 RIM8YGL045W 1629 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP43P25359 ACH1YBL015W 1581 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP43P25359 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP43P25359 OPI10YOL032W 741 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP43P25359 GND2YGR256W 1479 nt10.18□□□□□ -0.78
RRP43P25359 RBG1YAL036C 1110 nt10.18□□□□□ -0.78
RRP43P25359 YLR279WYLR279W 390 nt10.17□□□□□ -0.78
RRP43P25359 YMR103CYMR103C 363 nt10.17□□□□□ -0.78
RRP43P25359 CWC15YDR163W 528 nt10.16□□□□□ -0.78
RRP43P25359 PET8YNL003C 855 nt10.16□□□□□ -0.78
RRP43P25359 LSB6YJL100W 1824 nt10.15□□□□□ -0.78
RRP43P25359 FMS1YMR020W 1527 nt10.15□□□□□ -0.78
RRP43P25359 HEL2YDR266C 1920 nt10.15□□□□□ -0.79
RRP43P25359 FLR1YBR008C 1647 nt10.15□□□□□ -0.79
RRP43P25359 CCT2YIL142W 1584 nt10.14□□□□□ -0.79
RRP43P25359 UGA4YDL210W 1716 nt10.14□□□□□ -0.79
RRP43P25359 MEP3YPR138C 1470 nt10.14□□□□□ -0.79
RRP43P25359 MSB4YOL112W 1479 nt10.13□□□□□ -0.79
RRP43P25359 ARO8YGL202W 1503 nt10.12□□□□□ -0.79
RRP43P25359 TSC10YBR265W 963 nt10.12□□□□□ -0.79
RRP43P25359 COQ8YGL119W 1506 nt10.12□□□□□ -0.79
RRP43P25359 ZAP1YJL056C 2643 nt10.11□□□□□ -0.79
RRP43P25359 YPS3YLR121C 1527 nt10.1□□□□□ -0.79
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