Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA2P15927 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA2P15927 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA2P15927 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA2P15927 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA2P15927 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA2P15927 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA2P15927 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA2P15927 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA2P15927 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA2P15927 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA2P15927 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA2P15927 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA2P15927 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA2P15927 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA2P15927 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPA2P15927 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA2P15927 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA2P15927 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA2P15927 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA2P15927 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA2P15927 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA2P15927 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA2P15927 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA2P15927 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA2P15927 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA2P15927 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA2P15927 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA2P15927 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA2P15927 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA2P15927 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA2P15927 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA2P15927 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA2P15927 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA2P15927 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA2P15927 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA2P15927 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA2P15927 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA2P15927 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA2P15927 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA2P15927 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPA2P15927 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA2P15927 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA2P15927 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA2P15927 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA2P15927 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA2P15927 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA2P15927 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPA2P15927 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPA2P15927 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPA2P15927 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPA2P15927 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPA2P15927 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA2P15927 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA2P15927 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA2P15927 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA2P15927 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPA2P15927 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA2P15927 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA2P15927 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA2P15927 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA2P15927 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA2P15927 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA2P15927 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA2P15927 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA2P15927 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA2P15927 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA2P15927 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA2P15927 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPA2P15927 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA2P15927 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA2P15927 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA2P15927 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA2P15927 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA2P15927 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA2P15927 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA2P15927 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA2P15927 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA2P15927 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA2P15927 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA2P15927 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA2P15927 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA2P15927 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA2P15927 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA2P15927 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA2P15927 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA2P15927 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA2P15927 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA2P15927 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA2P15927 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA2P15927 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA2P15927 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA2P15927 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA2P15927 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA2P15927 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA2P15927 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA2P15927 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA2P15927 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA2P15927 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA2P15927 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms