Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYL1P12980 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYL1P12980 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYL1P12980 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYL1P12980 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYL1P12980 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYL1P12980 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYL1P12980 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYL1P12980 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYL1P12980 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYL1P12980 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYL1P12980 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYL1P12980 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYL1P12980 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYL1P12980 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYL1P12980 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYL1P12980 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYL1P12980 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYL1P12980 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYL1P12980 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYL1P12980 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYL1P12980 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYL1P12980 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYL1P12980 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYL1P12980 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYL1P12980 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYL1P12980 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYL1P12980 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYL1P12980 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYL1P12980 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYL1P12980 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYL1P12980 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYL1P12980 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYL1P12980 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYL1P12980 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYL1P12980 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LYL1P12980 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYL1P12980 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYL1P12980 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYL1P12980 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYL1P12980 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYL1P12980 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYL1P12980 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYL1P12980 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYL1P12980 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYL1P12980 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYL1P12980 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYL1P12980 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYL1P12980 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYL1P12980 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LYL1P12980 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYL1P12980 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LYL1P12980 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYL1P12980 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYL1P12980 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYL1P12980 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LYL1P12980 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYL1P12980 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYL1P12980 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYL1P12980 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYL1P12980 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYL1P12980 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYL1P12980 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYL1P12980 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYL1P12980 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYL1P12980 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYL1P12980 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYL1P12980 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYL1P12980 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYL1P12980 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYL1P12980 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LYL1P12980 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYL1P12980 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYL1P12980 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYL1P12980 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYL1P12980 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYL1P12980 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYL1P12980 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYL1P12980 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYL1P12980 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYL1P12980 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYL1P12980 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYL1P12980 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYL1P12980 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYL1P12980 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LYL1P12980 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYL1P12980 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYL1P12980 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LYL1P12980 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYL1P12980 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYL1P12980 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYL1P12980 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYL1P12980 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYL1P12980 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYL1P12980 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYL1P12980 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYL1P12980 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYL1P12980 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYL1P12980 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYL1P12980 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms