Protein–RNA interactions for Protein: P12235

SLC25A4, ADP/ATP translocase 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A4P12235 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A4P12235 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A4P12235 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A4P12235 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A4P12235 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A4P12235 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A4P12235 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms