Protein–RNA interactions for Protein: O60831

PRAF2, PRA1 family protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAF2O60831 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAF2O60831 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAF2O60831 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAF2O60831 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAF2O60831 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAF2O60831 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAF2O60831 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAF2O60831 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAF2O60831 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAF2O60831 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAF2O60831 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAF2O60831 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAF2O60831 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAF2O60831 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms