Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM17BO60830 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMM17BO60830 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM17BO60830 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMM17BO60830 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMM17BO60830 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms