Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8B1O43520 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B1O43520 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8B1O43520 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8B1O43520 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8B1O43520 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP8B1O43520 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP8B1O43520 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8B1O43520 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8B1O43520 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP8B1O43520 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP8B1O43520 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8B1O43520 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8B1O43520 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms