Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPLO15194 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPLO15194 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDSPLO15194 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDSPLO15194 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPLO15194 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPLO15194 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPLO15194 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPLO15194 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPLO15194 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPLO15194 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPLO15194 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPLO15194 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPLO15194 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPLO15194 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms