Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVG6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A1B0GVG6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GVG6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GVG6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GVG6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GVG6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GVG6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GVG6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GVG6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GVG6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GVG6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVG6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1B0GVG6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1B0GVG6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GVG6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1B0GVG6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms