Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC008897.3-201ENST00000607296 483 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GCA-204ENST00000437150 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DPYD-201ENST00000306031 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 EXD2-201ENST00000312994 5107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 EHMT1-240ENST00000637318 2983 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NEFM-203ENST00000437366 3148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC02193-203ENST00000568418 2056 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SPATA13-213ENST00000439928 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AP000708.1-201ENST00000527818 3423 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PRAMENP-202ENST00000419303 1869 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MRPL10-201ENST00000290208 2013 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ANAPC10-217ENST00000613466 1674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BCAT1-205ENST00000539282 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DNTT-201ENST00000371174 1972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TRPV5-203ENST00000442623 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC007610.4-201ENST00000623307 2125 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 EPC1-201ENST00000263062 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PIP4K2C-201ENST00000354947 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZNF682-203ENST00000397165 3245 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MIR497-201ENST00000385056 112 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AP005018.2-201ENST00000528464 822 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RIN1-208ENST00000627248 243 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 THRB-201ENST00000280696 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TACR1-201ENST00000305249 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LRRC55-201ENST00000497933 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PTGFR-201ENST00000370756 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LEMD1-AS1-201ENST00000447832 2781 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 C3orf35-205ENST00000426078 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC01572-206ENST00000624829 1666 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC00665-208ENST00000591372 2732 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 C11orf1-201ENST00000260276 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 EIF2S1-201ENST00000256383 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC104667.1-201ENST00000417947 2057 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CYTH4-201ENST00000248901 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC012377.1-201ENST00000499797 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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