Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FCGR1A-201ENST00000369168 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 EFHC1-219ENST00000636379 1829 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PRICKLE1-209ENST00000552240 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HRH2-201ENST00000231683 1080 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MYLPF-201ENST00000322861 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TCL6-204ENST00000460130 911 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HDAC2-AS2-215ENST00000522697 786 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ACTG1P16-201ENST00000564713 1082 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AL513485.1-201ENST00000617915 845 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC127526.5-201ENST00000637148 1110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AL009178.1-201ENST00000392115 1486 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AL050303.4-201ENST00000624520 1839 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HSPA8P7-201ENST00000443628 1948 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ZNF683-202ENST00000403843 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PLA2G4C-219ENST00000599111 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PPP1R2P9-201ENST00000378131 880 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TIRAP-201ENST00000392678 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 XIAP-AS1-201ENST00000458331 482 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC092329.1-201ENST00000594653 574 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC239801.1-201ENST00000458399 1398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CXorf56-201ENST00000320339 2372 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 STAT6-220ENST00000556155 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms