Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZNF226-212ENST00000588795 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC016292.2-201ENST00000618967 210 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KIAA0319L-202ENST00000373266 2377 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 S1PR3-201ENST00000358157 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC079880.1-201ENST00000603040 2046 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RABEPK-203ENST00000373544 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SCGB2B2-203ENST00000601241 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 FCHO1-218ENST00000596951 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 VDAC1-202ENST00000395044 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC092447.8-201ENST00000566570 4162 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CRX-202ENST00000539067 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 UGT1A9-201ENST00000354728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TRAF3IP2-208ENST00000392556 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LINC01210-204ENST00000478772 1288 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LINC01391-203ENST00000495287 3538 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PES1P1-201ENST00000508165 1736 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LINC02105-202ENST00000511953 870 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC008897.3-201ENST00000607296 483 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC137834.2-201ENST00000617433 701 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CR2-201ENST00000367057 4240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PIGO-203ENST00000378617 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TSTA3-210ENST00000529064 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RBM28-202ENST00000415472 2251 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ARHGEF15-201ENST00000361926 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 NPSR1-209ENST00000531252 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 HEXA-AS1-201ENST00000567598 2676 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PITX2-212ENST00000614423 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 POGLUT1-201ENST00000295588 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 DAP3-202ENST00000368336 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RHO-201ENST00000296271 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms