Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF682-202ENST00000397162 3164 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NELL2-204ENST00000437801 3279 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PCYOX1-204ENST00000433351 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PLK4-201ENST00000270861 3841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 WASHC2A-201ENST00000282633 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL021877.1-201ENST00000457251 2194 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 POTEA-201ENST00000519951 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CHST4-201ENST00000338482 2412 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FAM124B-202ENST00000389874 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GRIK3-202ENST00000373093 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TAGAP-201ENST00000326965 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 STK31-202ENST00000355870 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PARD6G-AS1-202ENST00000586421 3333 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ARHGAP30-203ENST00000368016 3482 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CARD14-201ENST00000344227 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 VAC14-AS1-202ENST00000562507 4853 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DMC1-201ENST00000216024 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ARL1-201ENST00000261636 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TMEM139-204ENST00000409541 1907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CPVL-203ENST00000409850 2213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC00689-201ENST00000413238 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DCTN2-201ENST00000434715 1677 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 EHF-202ENST00000450654 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZNF544-213ENST00000599227 3587 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SNAP25-AS1-207ENST00000603542 3207 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLC4A1AP-204ENST00000613058 2966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DACH2-208ENST00000613770 1731 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC025280.2-201ENST00000625056 2547 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MYBPC3-201ENST00000256993 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MYBPC3-202ENST00000399249 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PTK7-213ENST00000481273 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 EPHB2-202ENST00000374630 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLC4A5-202ENST00000358683 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 EXD2-205ENST00000409675 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CD22-203ENST00000419549 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ITGB6-205ENST00000428609 2576 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 METTL2B-201ENST00000262432 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KIAA1683-207ENST00000600359 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ACKR1-204ENST00000537147 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MYO1C-204ENST00000545534 3676 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PRICKLE1-205ENST00000548696 3635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AP000356.2-201ENST00000639904 4634 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 HHAT-209ENST00000545781 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FMR1-220ENST00000621987 1352 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZNF446-205ENST00000596341 3922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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