Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MTHFD1-210ENST00000555252 2053 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CAP1-213ENST00000427843 739 ntTSL 511.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CDK5RAP3-227ENST00000583352 901 ntTSL 310.71□□□□□ -0.691e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GULP1-201ENST00000359135 3347 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 OSGEP-204ENST00000554249 987 ntTSL 210.67□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SOD2-216ENST00000546260 4302 ntTSL 510.64□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ORC6-205ENST00000567000 1560 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CPED1-208ENST00000495036 2198 ntTSL 1 (best)10.62□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 UROD-202ENST00000428106 682 ntTSL 310.58□□□□□ -0.725e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LINC01359-208ENST00000635398 1517 ntTSL 510.57□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TATDN3-215ENST00000532433 561 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CNOT1-207ENST00000565605 739 ntTSL 410.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LARP4B-210ENST00000609318 4848 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-217ENST00000559690 680 ntTSL 310.33□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FNBP4-216ENST00000544590 491 ntTSL 210.33□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CCNG1-210ENST00000511683 1071 ntTSL 210.22□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CSNK1A1-203ENST00000503350 1099 ntTSL 210.21□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM59-203ENST00000371341 1116 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ARFGEF1-203ENST00000518230 2734 ntTSL 510.1□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RAN-204ENST00000464211 562 ntTSL 510.08□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 COPS7B-214ENST00000449784 978 ntTSL 310.07□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CPED1-210ENST00000521774 264 ntTSL 29.98□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GULP1-205ENST00000409805 983 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 BOLA3-AS1-201ENST00000423477 1804 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MBNL1-208ENST00000460166 552 ntTSL 49.83□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CDK5RAP3-220ENST00000581160 490 ntTSL 39.79□□□□□ -0.841e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.858e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MTHFD1-203ENST00000553391 568 ntTSL 49.7□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CDK5RAP3-208ENST00000578525 564 ntTSL 49.66□□□□□ -0.861e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TDG-202ENST00000392872 3251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 BAIAP2L1-205ENST00000480580 689 ntTSL 49.52□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KANSL2-201ENST00000420613 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM183A-204ENST00000488097 555 ntTSL 59.45□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TYW5-204ENST00000483328 4287 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CIR1-202ENST00000377973 561 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SUPV3L1-202ENST00000422378 794 ntTSL 59.27□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NADK2-208ENST00000511088 579 ntTSL 49.2□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GNL1-203ENST00000462708 774 ntTSL 29.15□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KDM2A-205ENST00000525041 697 ntTSL 49.09□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ADAL-207ENST00000566154 2582 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CREBRF-205ENST00000522692 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PRMT1-208ENST00000527412 463 ntTSL 38.81□□□□□ -12e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CREBRF-204ENST00000520464 5163 ntTSL 28.8□□□□□ -12e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KANSL2-202ENST00000546701 1881 ntTSL 28.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 43.1
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SF3B1O75533 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FRYL-201ENST00000302806 2365 ntTSL 28.46□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FNBP4-206ENST00000527894 610 ntTSL 38.35□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 BCOR-211ENST00000490976 3480 ntTSL 28.3□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TYW5-205ENST00000493181 6525 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LDAH-210ENST00000470099 2116 ntTSL 28.19□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KANSL2-211ENST00000549574 1625 ntTSL 58.08□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KANSL2-205ENST00000547582 581 ntTSL 58.04□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-209ENST00000558830 616 ntTSL 38□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-206ENST00000506516 473 ntTSL 1 (best)7.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CAP1-212ENST00000424977 702 ntTSL 57.84□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 OSGEP-208ENST00000555656 3258 ntTSL 27.77□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 YLPM1-205ENST00000549293 5500 ntTSL 1 (best)7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LINC01359-209ENST00000635626 2465 ntTSL 57.45□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TAF15-202ENST00000603346 702 ntTSL 27.37□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RAN-203ENST00000448750 2455 ntTSL 27.28□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PSMB7-202ENST00000441097 650 ntTSL 57.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-212ENST00000559158 793 ntTSL 37.13□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 DGKD-206ENST00000447484 494 ntTSL 37.08□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-213ENST00000559244 582 ntTSL 37.07□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-221ENST00000560422 761 ntTSL 56.91□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SUPV3L1-204ENST00000478227 597 ntTSL 56.87□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 P3H1-208ENST00000460831 585 ntTSL 26.81□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-218ENST00000559697 551 ntTSL 56.81□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SEC22A-202ENST00000466519 572 ntTSL 46.71□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-204ENST00000504951 632 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 DGKD-209ENST00000472732 506 ntTSL 56.7□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 43.1
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