Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms